RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 AMDHD1Q96NU7 426 aa18.15■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa18.15■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 BBS4Q96RK4 519 aa18.15■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 SERINC2Q96SA4 455 aa18.15■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 FAM60AQ9NP50 221 aa18.15■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 RPS6KA6Q9UK32 745 aa18.15■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 PADI4Q9UM07 663 aa18.15■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 OAZ3Q9UMX2 235 aa18.15■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 MUC3AQ02505 3323 aa18.14■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 SOCS2O14508 198 aa18.14■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 ZNF682O95780 498 aa18.14■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 NTSP30990 170 aa18.14■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 RBBP4Q09028 425 aa18.14■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 SPDYE7PQ495Y7 208 aa18.14■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 C14orf28Q4W4Y0 310 aa18.14■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 LYSMD4Q5XG99 296 aa18.14■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 SAXO2Q658L1 398 aa18.14■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 IRGCQ6NXR0 463 aa18.14■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 GALNT10Q86SR1 603 aa18.14■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 EPHX4Q8IUS5 362 aa18.14■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa18.14■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 C9orf16Q9BUW7 83 aa18.14■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 TMEM38AQ9H6F2 299 aa18.14■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa18.14■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 SCN3AQ9NY46 2000 aa18.14■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 PDLIM1O00151 329 aa18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 ALOX12P18054 663 aa18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 HSPA13P48723 471 aa18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 MED21Q13503 144 aa18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 TMTC4Q5T4D3 741 aa18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 WDR5BQ86VZ2 330 aa18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 CBR4Q8N4T8 237 aa18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 CSNK1A1LQ8N752 337 aa18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 VPS50Q96JG6 964 aa18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 ZNF597Q96LX8 424 aa18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 CCDC3Q9BQI4 270 aa18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 KCMF1Q9P0J7 381 aa18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 RAB26Q9ULW5 256 aa18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 C7orf72A4D263 438 aa18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 MYO1GB0I1T2 1018 aa18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 TXNDC9O14530 226 aa18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 ACOX3O15254 700 aa18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 HCRTR1O43613 425 aa18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 B3GALT2O43825 422 aa18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 NR2F6P10588 404 aa18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 TDGF1P13385 188 aa18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 GPC1P35052 558 aa18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 CBLL1Q75N03 491 aa18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 C6orf120Q7Z4R8 191 aa18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 PACRGLQ8N7B6 248 aa18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 ZFP28Q8NHY6 868 aa18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 NTN4Q9HB63 628 aa18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 PHF11Q9UIL8 331 aa18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 ENTPD4Q9Y227 616 aa18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 A0A1B0GTW7 788 aa18.12■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 PRSS23O95084 383 aa18.12■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 CST1P01037 141 aa18.12■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 AQP1P29972 269 aa18.12■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 CTSKP43235 329 aa18.12■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 CCT3P49368 545 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 LIM2P55344 173 aa18.12■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 BNIP3Q12983 259 aa18.12■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 RUNX2Q13950 521 aa18.12■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 SCARB2Q14108 478 aa18.12■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 ZNF750Q32MQ0 723 aa18.12■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 SPRED1Q7Z699 444 aa18.12■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 CCDC116Q8IYX3 515 aa18.12■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 SLC25A45Q8N413 288 aa18.12■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 KLHL6Q8WZ60 621 aa18.12■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 MAP3K3Q99759 626 aa18.12■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 PSME2Q9UL46 239 aa18.12■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 DAPP1Q9UN19 280 aa18.12■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 RHPN2P1A8MT19 583 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 LAMTOR5O43504 91 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 DENRO43583 198 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 B4GALT2O60909 372 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 DNAJB6O75190 326 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 C9P02748 559 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 C8orf89P0DMQ9 161 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 GNSP15586 552 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 CPN2P22792 545 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 FEN1P39748 380 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms