RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 TMCC3Q9ULS5 477 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 PLXNA3P51805 1871 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 WWP2O00308 870 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 KIAA0513O60268 411 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 SCO1O75880 301 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 SYN1P17600 705 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 CNR2P34972 360 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 SIGIRRQ6IA17 410 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 SYCE2Q6PIF2 218 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 LIPIQ6XZB0 460 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 PRSS48Q7RTY5 328 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 SLC6A16Q9GZN6 736 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 KCNK12Q9HB15 430 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 A0A1W2PQ72 361 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 SMLR1H3BR10 107 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 PRKCAP17252 672 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 CRYBA2P53672 197 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 PXDC1Q5TGL8 231 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 OR8J2Q8NGG1 315 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 NACC2Q96BF6 587 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 SP140LQ9H930 580 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 TOR4AQ9NXH8 423 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 OSGIN1Q9UJX0 560 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 PCM1Q15154 2024 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 PPM1DO15297 605 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 PCCBP05166 539 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 C8orf89P0DMQ9 161 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 TGFBR2P37173 567 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 SOX3P41225 446 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 MAPK12P53778 367 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 KEAP1Q14145 624 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 STK11Q15831 433 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 GRHL2Q6ISB3 625 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC149Q6ZUS6 474 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 SPERTQ8NA61 448 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 B3GNT7Q8NFL0 401 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 C16orf78Q8WTQ4 265 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 APH1BQ8WW43 257 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 C7orf34Q96L11 122 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 FERD3LQ96RJ6 166 aa18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 OR2A25A4D2G3 310 aa18.95■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 EFCAB10A6NFE3 127 aa18.95■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 M0R082 166 aa18.95■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 DGKGP49619 791 aa18.95■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 CDC42P60953 191 aa18.95■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 FAM124AQ86V42 546 aa18.95■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 SYNPOQ8N3V7 929 aa18.95■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 ARMC5Q96C12 935 aa18.95■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 ECHDC3Q96DC8 303 aa18.95■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 COL21A1Q96P44 957 aa18.95■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 PRR14Q9BWN1 585 aa18.95■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 ASIC5Q9NY37 505 aa18.95■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 SLC28A2O43868 658 aa18.95■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 IFNW1P05000 195 aa18.95■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 NPPBP16860 134 aa18.95■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 HTR2BP41595 481 aa18.95■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 MAGEA2P43356 314 aa18.95■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 CERS4Q9HA82 394 aa18.95■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 FBXL12Q9NXK8 326 aa18.95■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 TVP23BQ9NYZ1 205 aa18.95■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 CCNB2O95067 398 aa18.94■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 SNX4O95219 450 aa18.94■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF181Q2M3W8 571 aa18.94■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 GGTA1PQ4G0N0 100 aa18.94■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 SPIN4Q56A73 249 aa18.94■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 CNKSR3Q6P9H4 555 aa18.94■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa18.94■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa18.94■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa18.94■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 IL17RDQ8NFM7 739 aa18.94■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 OR5D16Q8NGK9 328 aa18.94■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 GPATCH2Q9NW75 528 aa18.94■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 OR6C70A6NIJ9 312 aa18.94■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 HAT1O14929 419 aa18.94■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 SLC7A9P82251 487 aa18.94■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 SP140Q13342 867 aa18.94■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF805Q5CZA5 627 aa18.94■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 UCN3Q969E3 161 aa18.94■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 LYSMD1Q96S90 227 aa18.94■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa18.94■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 SAGE2PA6NJ88 616 aa18.94■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 LATS1O95835 1130 aa18.94■□□□□ 0.62
SPNS2-201ENST00000329078 GASTP01350 101 aa18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms