RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 BCHEP06276 602 aa20.64■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 PCMT1P22061 227 aa20.64■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 XCR1P46094 333 aa20.64■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 KIAA1024LP59773 190 aa20.64■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa20.64■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF793Q6ZN11 406 aa20.64■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 USP30Q70CQ3 517 aa20.64■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 SLC5A8Q8N695 610 aa20.64■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 PSMA8Q8TAA3 256 aa20.64■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 RAB2BQ8WUD1 216 aa20.64■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 HRASLS5Q96KN8 279 aa20.64■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 PIP5K1AQ99755 562 aa20.64■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 KLHL31Q9H511 634 aa20.64■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 DUSP21Q9H596 190 aa20.64■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 EHD3Q9NZN3 535 aa20.64■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 AASSQ9UDR5 926 aa20.64■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa20.64■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 AHRP35869 848 aa20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 CCT3P49368 545 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 LRRC32Q14392 662 aa20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 SLC9A5Q14940 896 aa20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 PROX2Q3B8N5 592 aa20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 ADPRMQ3LIE5 342 aa20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM145Q8NBT3 493 aa20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 DGCR6LQ9BY27 220 aa20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 SPHK1Q9NYA1 384 aa20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 SNX11Q9Y5W9 270 aa20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 ENPP4Q9Y6X5 453 aa20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 A0A1W2PPW3 197 aa20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 ACADMP11310 421 aa20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 CCNA2P20248 432 aa20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 CMPK1P30085 196 aa20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 CLDN2P57739 230 aa20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 SLC35A2P78381 396 aa20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 KCNC4Q03721 635 aa20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 NPTX1Q15818 432 aa20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 LAIR1Q6GTX8 287 aa20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 ENPP7Q6UWV6 458 aa20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 LGI4Q8N135 537 aa20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 FBXL6Q8N531 539 aa20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 UCN3Q969E3 161 aa20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 MS4A6EQ96DS6 147 aa20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM19Q96HH6 336 aa20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 SARGQ9BW04 601 aa20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 POFUT2Q9Y2G5 429 aa20.63■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 A8MVJ9 347 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 J3KTA2 159 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 ERI3O43414 337 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 B4GALT2O60909 372 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 STATHP02808 62 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 IFNW1P05000 195 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 TFPTP0C1Z6 253 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 RHCEP18577 417 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 CALRP27797 417 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 HYAL2Q12891 473 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 DUSP7Q16829 419 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 GPR153Q6NV75 609 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 DTNBP1Q96EV8 351 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 KCNC2Q96PR1 638 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 ERVK-18Q9QC07 812 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 MYO9BQ13459 2157 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 ANHXE9PGG2 379 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 PDE9AO76083 593 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 ARFIP1P53367 373 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 TP53BP2Q13625 1128 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 FGD3Q5JSP0 725 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF605Q86T29 641 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 GAB3Q8WWW8 586 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 OR1E3Q8WZA6 343 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 THAP11Q96EK4 314 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 MACROD1Q9BQ69 325 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 GLIPR2Q9H4G4 154 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 RASSF1Q9NS23 344 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 ACER3Q9NUN7 267 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 ZSCAN32Q9NX65 697 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 TBC1D29Q9UFV1 150 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa20.62■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa20.61■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 HMGN4O00479 90 aa20.61■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 GUCY1B2O75343 617 aa20.61■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 NDUFS1P28331 727 aa20.61■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 GPC1P35052 558 aa20.61■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 HMGA2P52926 109 aa20.61■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 MAPK10P53779 464 aa20.61■□□□□ 0.89
SPHK1-201ENST00000323374 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms