RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 LOC730098B7Z3J9 87 aa23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 PCDH17O14917 1159 aa23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 AP2A2O94973 939 aa23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 TACR1P25103 407 aa23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 ARHGEF7Q14155 803 aa23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 TRIQKQ629K1 86 aa23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 MZT2BQ6NZ67 158 aa23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 C16orf62Q7Z3J2 963 aa23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 SLC34A3Q8N130 599 aa23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 CHTF18Q8WVB6 975 aa23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 IGSF21Q96ID5 467 aa23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 CRLS1Q9UJA2 301 aa23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 SCML1Q9UN30 329 aa23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 MYOFQ9NZM1 2061 aa23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 CSO75390 466 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 CCNB2O95067 398 aa23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 CFL1P23528 166 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 STK19P49842 368 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 RAB25P57735 213 aa23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 ABATP80404 500 aa23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 RHAGQ02094 409 aa23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 DDI2Q5TDH0 399 aa23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 ARSKQ6UWY0 536 aa23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 MARVELD1Q9BSK0 173 aa23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 C5orf42Q9H799 3197 aa23.5■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 PTPRSQ13332 1948 aa23.5■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 SERPINI2O75830 405 aa23.5■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 TESCQ96BS2 214 aa23.5■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 TMEM175Q9BSA9 504 aa23.5■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 SSR3Q9UNL2 185 aa23.5■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 CDH23Q9H251 3354 aa23.5■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa23.5■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 LYRM1O43325 122 aa23.5■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 ORC5O43913 435 aa23.5■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 SLC43A1O75387 559 aa23.5■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 POU2F1P14859 743 aa23.5■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 AQP1P29972 269 aa23.5■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 BCL2L1Q07817 233 aa23.5■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 IKZF1Q13422 519 aa23.5■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 GARNL3Q5VVW2 1013 aa23.5■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 STK40Q8N2I9 435 aa23.5■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 MYLIPQ8WY64 445 aa23.5■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 MANBAO00462 879 aa23.49■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 HCN1O60741 890 aa23.49■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 LGI1O95970 557 aa23.49■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 HLA-DQB1P01920 261 aa23.49■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 PRKAR1AP10644 381 aa23.49■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 RIN1Q13671 783 aa23.49■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 LGI4Q8N135 537 aa23.49■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 Q8N402 240 aa23.49■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa23.49■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 SH3BP4Q9P0V3 963 aa23.49■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 MALT1Q9UDY8 824 aa23.49■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 MGAT4AQ9UM21 535 aa23.49■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 COL4A6Q14031 1691 aa23.49■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 DOCK6Q96HP0 2047 aa23.49■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 UPK3BL1B0FP48 263 aa23.49■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 UPK3BL2E5RIL1 263 aa23.49■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 TOR1AO14656 332 aa23.49■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 RAF1P04049 648 aa23.49■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 ANXA8P13928 327 aa23.49■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 TNFRSF1BP20333 461 aa23.49■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 SPHARQ15513 63 aa23.49■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 TRIM69Q86WT6 500 aa23.49■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 ZBTB44Q8NCP5 570 aa23.49■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 GPR26Q8NDV2 337 aa23.49■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 OR9Q2Q8NGE9 314 aa23.49■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 BADQ92934 168 aa23.49■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 NDUFB11Q9NX14 153 aa23.49■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 FAM8A1Q9UBU6 413 aa23.49■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa23.48■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 SH3D21A4FU49 640 aa23.48■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 GREM1O60565 184 aa23.48■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 TRBC1P01850 177 aa23.48■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 SRCP12931 536 aa23.48■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 GPX2P18283 190 aa23.48■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 CD70P32970 193 aa23.48■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 DGKKQ5KSL6 1271 aa23.48■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 RNF175Q8N4F7 328 aa23.48■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa23.48■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 NDUFAF4Q9P032 175 aa23.48■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 TMCC3Q9ULS5 477 aa23.48■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa23.48■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 SUV39H1O43463 412 aa23.48■■□□□ 1.35
PKDCC-201ENST00000294964 TPST2O60704 377 aa23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms