RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291386.3

SSU72-201, Transcript of SSU72 homolog, RNA polymerase II CTD phosphatase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SSU72, Length 1,290 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72-201ENST00000291386 ACSM2AQ08AH3 577 aa25.22■■□□□ 1.63
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SSU72-201ENST00000291386 ACSM2BQ68CK6 577 aa25.22■■□□□ 1.63
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SSU72-201ENST00000291386 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SSU72-201ENST00000291386 SLC25A18Q9H1K4 315 aa25.18■■□□□ 1.62
SSU72-201ENST00000291386 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa25.18■■□□□ 1.62
SSU72-201ENST00000291386 C1orf226A1L170 272 aa25.17■■□□□ 1.62
SSU72-201ENST00000291386 A6NL46 340 aa25.17■■□□□ 1.62
SSU72-201ENST00000291386 PIP5K1BO14986 540 aa25.17■■□□□ 1.62
SSU72-201ENST00000291386 SNNO75324 88 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
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