RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288022.1

PDF-201, Transcript of peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDF, Length 1,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDF-201ENST00000288022 LIPMQ5VYY2 423 aa23.51■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 C18orf63Q68DL7 685 aa23.51■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 PAGE2Q7Z2X7 111 aa23.51■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 CUZD1Q86UP6 607 aa23.51■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 CATSPER1Q8NEC5 780 aa23.51■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 AGAP11Q8TF27 550 aa23.51■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 ABI3Q9P2A4 366 aa23.51■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 CCDC151A5D8V7 595 aa23.5■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 ULK1O75385 1050 aa23.5■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 ESRRBO95718 433 aa23.5■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 WDPCPO95876 746 aa23.5■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 TNNI3P19429 210 aa23.5■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 SERTAD2Q14140 314 aa23.5■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 TERF2Q15554 542 aa23.5■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 MEP1AQ16819 746 aa23.5■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 ACER2Q5QJU3 275 aa23.5■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa23.5■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 H3F3CQ6NXT2 135 aa23.5■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 FRMD7Q6ZUT3 714 aa23.5■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 CRLF3Q8IUI8 442 aa23.5■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 C10orf107Q8IVU9 208 aa23.5■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 OR4N5Q8IXE1 308 aa23.5■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 B3GNT7Q8NFL0 401 aa23.5■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 ELP5Q8TE02 316 aa23.5■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 FAM111AQ96PZ2 611 aa23.5■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 KCNA7Q96RP8 456 aa23.5■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 WDR41Q9HAD4 459 aa23.5■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 ASB4Q9Y574 426 aa23.5■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 TIMM22Q9Y584 194 aa23.5■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa23.5■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 PROM1O43490 865 aa23.49■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 FGF17O60258 216 aa23.49■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 CRCPO75575 148 aa23.49■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 NR2F6P10588 404 aa23.49■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 PCLAFQ15004 111 aa23.49■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 BEST3Q8N1M1 668 aa23.49■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 METTL4Q8N3J2 472 aa23.49■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa23.49■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 OR1N1Q8NGS0 311 aa23.49■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 HAS2Q92819 552 aa23.49■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 TANKQ92844 425 aa23.49■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 DEFB126Q9BYW3 111 aa23.49■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 CENPHQ9H3R5 247 aa23.49■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 SLC17A7Q9P2U7 560 aa23.49■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 ADAM29Q9UKF5 820 aa23.49■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa23.49■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa23.48■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 A0A1W2PR48 441 aa23.48■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 GLOD5A6NK44 160 aa23.48■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 WISP1O95388 367 aa23.48■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 HSD3B1P14060 373 aa23.48■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 HSD3B2P26439 372 aa23.48■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 HTR6P50406 440 aa23.48■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 CLCN2P51788 898 aa23.48■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 FOXK1P85037 733 aa23.48■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 ASPHQ12797 758 aa23.48■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 COMMD6Q7Z4G1 85 aa23.48■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 C7orf57Q8NEG2 295 aa23.48■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 TCP10LQ8TDR4 215 aa23.48■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 RNF32Q9H0A6 362 aa23.48■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 CDCP1Q9H5V8 836 aa23.48■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 VPS29Q9UBQ0 182 aa23.48■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 VTI1BQ9UEU0 232 aa23.48■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa23.48■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 OR5H15A6NDH6 313 aa23.47■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 ERLIN1O75477 346 aa23.47■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 AIFM1O95831 613 aa23.47■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 MAPK12P53778 367 aa23.47■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 FOLH1Q04609 750 aa23.47■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 CEP85LQ5SZL2 805 aa23.47■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 SUN3Q8TAQ9 357 aa23.47■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 NCLNQ969V3 563 aa23.47■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 MIB2Q96AX9 1013 aa23.47■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 ZBTB9Q96C00 473 aa23.47■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 VMP1Q96GC9 406 aa23.47■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 DGAT2Q96PD7 388 aa23.47■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa23.47■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 SENP1Q9P0U3 644 aa23.47■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 TRAV17A0A0B4J275 112 aa23.46■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 C17orf105B2RV13 164 aa23.46■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 H3BQF6 201 aa23.46■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 MAN1A2O60476 641 aa23.46■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 TRIM13O60858 407 aa23.46■■□□□ 1.35
PDF-201ENST00000288022 COX7A2P14406 83 aa23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 150 ms