RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000032487.13

Vamp1-201, Transcript of Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vamp1, Length 2,772 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Epb41l4bQ9JMC8 527 aa11.16□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Kcne4Q9WTW3 170 aa11.16□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Arid2E9Q7E2 1828 aa11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 4930563M21RikA0A1L1SUT5 578 aa11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm10720D3Z1I5 223 aa11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Coq10aE9Q3H6 259 aa11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Dbx2F8VQH7 377 aa11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cldn20G5E8X0 219 aa11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 TspearJ3S6Y1 670 aa11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Sec22bO08547 215 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Fpr-rs3O88537 343 aa11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 LdhcP00342 332 aa11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Stfa2P35174 103 aa11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Slc11a1P41251 548 aa11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Capza2P47754 286 aa11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Inpp1P49442 396 aa11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 GiprQ0P543 460 aa11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 TfptQ3U1J1 259 aa11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Dcp1bQ3U564 578 aa11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 D13Ertd608eQ3UPR8 151 aa11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Syndig1lQ3USQ7 237 aa11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Fbxw11Q5SRY7 542 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pan2Q8BGF7 1200 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Reep1Q8BGH4 201 aa11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Slc7a6Q8BGK6 515 aa11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 C1rbQ8CFG9 706 aa11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pcdhb16Q91Y03 802 aa11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Adam33Q923W9 797 aa11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Marveld3Q9D956 376 aa11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tmem43Q9DBS1 400 aa11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tmod3Q9JHJ0 352 aa11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 C1galt1Q9JJ06 363 aa11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Insl5Q9WUG6 135 aa11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Slc22a5Q9Z0E8 557 aa11.15□□□□□ -0.62
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Adh6bA0A1D5RMB0 384 aa11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Sdccag3A2AIW0 432 aa11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Btnl6A2CG22 539 aa11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pate3B3GLJ3 98 aa11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Vmn2r108E9PYS0 855 aa11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gpr31F8VQN3 319 aa11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm7970L7N271 213 aa11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm7980L7N471 213 aa11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cnih2O35089 160 aa11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 HgfQ08048 728 aa11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 TepsinQ3U3N6 573 aa11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Lmf1Q3U3R4 574 aa11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Dhrs9Q58NB6 319 aa11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mup20Q5FW60 181 aa11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ppp3r2Q63811 179 aa11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Adh7Q64437 374 aa11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 SepsecsQ6P6M7 504 aa11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cyp2d40Q6P8N9 338 aa11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Camk2dQ6PHZ2 499 aa11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 TpppQ7TQD2 218 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr23Q7TRX4 325 aa11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr169Q7TS53 313 aa11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Sik2Q8CFH6 931 aa11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Vmn1r30Q8R2D2 302 aa11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Paip1Q8VE62 400 aa11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr1504Q8VFQ4 315 aa11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Fyttd1Q91Z49 317 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cstf3Q99LI7 717 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cndp2Q9D1A2 475 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 DtnaQ9D2N4 746 aa11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Panx1Q9JIP4 426 aa11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rgs20Q9QZB1 239 aa11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Padi1Q9Z185 662 aa11.15□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cfap77A0A087WRI3 283 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr427E9Q7E7 315 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm28048F7BCN0 99 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm20828J3KMI7 228 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm3542K7N6U2 270 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Vmn2r88L7N1W8 857 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Vmn2r8L7N472 848 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Atxn2O70305 1285 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Yme1l1O88967 715 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 MbP04247 154 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pou5f1P20263 352 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 CenpcP49452 906 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Hrh2P97292 397 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rgs16P97428 201 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cxcr5Q04683 374 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Map4k2Q61161 821 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 C730034F03RikQ8BGL5 111 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gpr21Q8BX79 349 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Slc22a22Q8R0S9 554 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Sla2Q8R4L0 259 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Camkk1Q8VBY2 505 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Syt17Q920M7 470 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 ArskQ9D2L1 553 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Atad1Q9D5T0 361 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cyp3a44Q9EQW4 504 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 PbkQ9JJ78 330 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Aqp9Q9JJJ3 295 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 SnapinQ9Z266 136 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Fam131cA2ADB2 273 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm436B1AVU6 407 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm4302E9PX25 294 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 4930426L09RikE9Q0N7 123 aa11.14□□□□□ -0.63
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Lsm2O35900 95 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 51.1 ms