RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028386.11

Nckap1-201, Transcript of Nck-associated protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nckap1, Length 4,469 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Olfr850Q8VFF2 315 aa20.25■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 MlycdQ99J39 492 aa20.25■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 PigkQ9CXY9 395 aa20.25■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Nrip2Q9JHR9 270 aa20.25■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Noa1Q9JJG9 693 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 TsxP70675 144 aa20.24■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Abcb7Q61102 752 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gm10800D3Z496 220 aa20.24■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gm19965J3QNY8 723 aa20.24■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gm13128L7MU96 475 aa20.24■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Rad51dO55230 329 aa20.24■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Mid1O70583 680 aa20.24■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Rph3aP47708 681 aa20.24■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Znf32Q80V23 272 aa20.24■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Cdkn3Q810P3 211 aa20.24■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Ccdc126Q8BIS8 140 aa20.24■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 McatQ8R3F5 381 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Olfr692Q8VF03 329 aa20.24■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Olfr1366A0A1W2P740 328 aa20.24■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Kcnk4O88454 398 aa20.24■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 M6prP24668 278 aa20.24■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Kcnc2Q14B80 642 aa20.24■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 1700020N01RikQ8CF20 87 aa20.24■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Uck2Q99PM9 261 aa20.24■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Prss23Q9D6X6 382 aa20.24■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Olfr239A0PK55 315 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Olfr1056A2AVY0 313 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Olfr55K7N6Q1 315 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 SrgnP13609 152 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Kcnj5P48545 419 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Kbtbd8Q3UQV5 599 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Vwa5b2Q3UR50 1248 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Pum1Q80U78 1189 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Dnajc27Q8CFP6 273 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Batf2Q8R1H8 277 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Mgat2Q921V5 442 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 AassQ99K67 926 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Cers5Q9D6K9 414 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gpc6Q9R087 555 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Tpk1Q9R0M5 243 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Trpm6Q8CIR4 2028 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Hnrnpa1P49312 320 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Tdrd6P61407 2134 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 E330014E10RikQ3UL33 481 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 D5Ertd577eQ499F0 481 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Cnih3Q6ZWS4 160 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Olfr1307Q7TQX1 312 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Itpk1Q8BYN3 419 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Mchr1Q8JZL2 353 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Dennd2dQ91VV4 469 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Xlr4aA2BI40 215 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Galntl6E5D8G1 601 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gm8906L7N2A2 181 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 IduaP48441 634 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Alg6Q3TAE8 507 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Coq8bQ566J8 533 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Mettl20Q80ZM3 255 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Mettl21eQ8CDZ2 244 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Rab28Q99KL7 221 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Dusp12Q9D0T2 339 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Slc7a9Q9QXA6 487 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Smok1Q9QYZ4 484 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Olfr560A0A1B0GSU5 314 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 4930438A08RikQ5SPH3 536 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 TifaQ793I8 184 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Tns4Q8BZ33 696 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Olfr808Q8VGI8 312 aa20.23■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Btaf1E9QAE3 1848 aa20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Sult2b1O35400 338 aa20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 PahP16331 453 aa20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Sorbs2Q3UTJ2 1180 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Taar7fQ5QD08 358 aa20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Taar7bQ5QD11 358 aa20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 ClpbQ60649 677 aa20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Unc5aQ8K1S4 898 aa20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Abcb8Q9CXJ4 717 aa20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Dusp13Q9QYJ7 198 aa20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gm11634A0A1B0GSX1 172 aa20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gm21972J3QN38 98 aa20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 NfkbieO54910 364 aa20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Rps6ka3P18654 740 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Wbp2P97765 261 aa20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Slc22a15Q504N2 544 aa20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Steap2Q8BWB6 489 aa20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gpr22Q8BZL4 432 aa20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Zbtb26Q8C8S0 451 aa20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Apbb3Q8R1C9 486 aa20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Fndc8Q9D2H8 321 aa20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Q9DAY5 185 aa20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Natd1Q9DBW3 110 aa20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Rai2Q9QVY8 529 aa20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Ptges3Q9R0Q7 160 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Orc6Q9WUJ8 262 aa20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Slc43a3A2AVZ9 502 aa20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Hcn1O88704 910 aa20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Znf423Q80TS5 1292 aa20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 GatcQ8CBY0 155 aa20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 GnalQ8CGK7 381 aa20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 EedQ921E6 441 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Bud23Q9CY21 281 aa20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27 ms