RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000013771.14

Trim54-201, Transcript of Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trim54, Length 1,434 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54-201ENSMUST00000013771 Has2P70312 552 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 FerP70451 823 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Fezf1Q0VDQ9 475 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Shisa6Q3UH99 525 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Scn2bQ56A07 215 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Gm11992Q5SS90 291 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Eif2dQ61211 570 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Man1c1Q6NXK9 625 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Prima1Q810F0 153 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Pcdh20Q8BIZ0 952 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 NagpaQ8BJ48 517 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Fam92aQ8BP22 355 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Rnf122Q8BP31 155 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Nudt9Q8BVU5 350 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Arhgap24Q8C4V1 747 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Zfp940Q8R2Q3 566 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Noxo1Q8VCM2 349 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Dennd2dQ91VV4 469 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Fam118aQ91YN1 357 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Eif2b1Q99LC8 305 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 SelenosQ9BCZ4 190 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Slc10a6Q9CXB2 373 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Pgm1Q9D0F9 562 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Dusp26Q9D700 211 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Phf7Q9DAG9 307 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Slco1c1Q9ERB5 715 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Ccdc22Q9JIG7 627 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Cyp2d22Q9JKY7 500 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Ap1m2Q9WVP1 423 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Ash1lQ99MY8 2958 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Rpl7a-ps3A0A140T8L1 270 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Kiaa1324A2AFS3 1009 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Serpinb3cA2RSF9 386 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Rtn2O70622 471 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 C9P06683 548 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Mcpt1P11034 246 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Scd1P13516 355 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Hoxd9P28357 339 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 FahP35505 419 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Hmx2P43687 273 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Calb2Q08331 271 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 CcnjlQ5SRT8 387 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 ProcrQ64695 242 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Ssx9Q6XAS3 170 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Ddhd1Q80YA3 547 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 R3hcc1lQ8BJM3 775 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 E330021D16RikQ8BW45 371 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Bend5Q8C6D4 421 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Tmem150cQ8C8S3 249 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Plbd1Q8VCI0 550 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Stx18Q8VDS8 334 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Olfr952Q8VFD7 314 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Siglec5Q920G3 569 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Olfr955Q9EQ97 314 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Actl7bQ9QY83 418 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 C2cd3Q52KB6 2323 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Lrrk1Q3UHC2 2014 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 4930469K13RikA0A286YDB2 92 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Gm28043E0CXC2 719 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Olfr603L7N1Y4 312 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Stam2O88811 523 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Il2raP01590 268 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 ChgbP16014 677 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Akr1b7P21300 316 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Krt6aP50446 553 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Cyth2P63034 400 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Akr1clQ3UXL1 322 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Ppp1r13lQ5I1X5 824 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Olfr10Q60883 311 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Lefty1Q64280 368 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 PigaQ64323 485 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Galnt2Q6PB93 570 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 DgkzQ80UP3 929 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Ppp1r12bQ8BG95 976 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Fam214bQ8BR27 538 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Hcar1Q8C131 343 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Apoa5Q8C7G5 368 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Mrpl47Q8K2Y7 252 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Nectin4Q8R007 508 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Olfr514Q8VFZ6 310 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Olfr53Q8VGL8 312 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Olfr649Q8VGW1 312 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 NifkQ91VE6 317 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Nphs2Q91X05 385 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Sh3bp4Q921I6 962 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Nsmce3Q9CPR8 279 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Exo5Q9CXP9 373 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Ccdc130Q9D516 385 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Ndufa11Q9D8B4 141 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Gtf2e2Q9D902 292 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Actr10Q9QZB7 417 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 1700023F06RikA2AB62 382 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Olfr1097A2AVA9 315 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 2210016F16RikG3X8U3 338 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Gm6408J3QNG1 320 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Gm3402K7N5P2 326 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Olfr237-ps1K9J725 310 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 DdcO88533 480 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Krt4P07744 525 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim54-201ENSMUST00000013771 Prl3b1P09586 222 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45 ms