RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 SOX30O94993 753 aa10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 CRTAMO95727 393 aa10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 GLI4P10075 376 aa10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 EPXP11678 715 aa10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 M6PRP20645 277 aa10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 GCAP28676 217 aa10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 CPOXP36551 454 aa10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 EFNA3P52797 238 aa10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 CDH6P55285 790 aa10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 TRIP10Q15642 601 aa10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 KCTD21Q4G0X4 260 aa10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 FCRLBQ6BAA4 426 aa10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 RTL6Q6ICC9 239 aa10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 SLC25A25Q6KCM7 469 aa10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 KDELC1Q6UW63 502 aa10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 GPR180Q86V85 440 aa10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 AMIGO1Q86WK6 493 aa10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 TSPAN14Q8NG11 270 aa10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 OR7G1Q8NGA0 311 aa10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 CALML6Q8TD86 181 aa10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 BRSK1Q8TDC3 778 aa10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 RASSF5Q8WWW0 418 aa10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 PEBP4Q96S96 227 aa10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 FERMT1Q9BQL6 677 aa10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 NDEL1Q9GZM8 345 aa10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 HACD3Q9P035 362 aa10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 PRELID1Q9Y255 219 aa10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 MAU2Q9Y6X3 613 aa10.95□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 A0A0G2JND7 137 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 FITM1A5D6W6 292 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 ANKRD34BA5PLL1 514 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 GOLGA8MH3BSY2 632 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 M0QX08 132 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 GPR39O43194 453 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 MAN1A2O60476 641 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 GZMAP12544 262 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 PEX2P28328 305 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 UQCRC1P31930 480 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 ST13P50502 369 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 NIPAL4Q0D2K0 466 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 CCNIQ14094 377 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 KLHL38Q2WGJ6 581 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 CHRFAM7AQ494W8 412 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 ANKDD1AQ495B1 522 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 BOLA3Q53S33 107 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 PPP4R4Q6NUP7 873 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 TMEM220Q6QAJ8 160 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 UNC5DQ6UXZ4 953 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 ZNF227Q86WZ6 799 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 LGI4Q8N135 537 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 ATPAF2Q8N5M1 289 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 TRIML2Q8N7C3 387 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 BANPQ8N9N5 519 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 OR2L2Q8NH16 312 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 ZNF354BQ96LW1 612 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 MROQ9BYG7 248 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 XKR8Q9H6D3 395 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 ARMC1Q9NVT9 282 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 ICKQ9UPZ9 632 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 AP4B1Q9Y6B7 739 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 MPDZO75970 2070 aa10.94□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 TFECO14948 347 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 H6PDO95479 791 aa10.93□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 CCDC159P0C7I6 412 aa10.93□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 RBP3P10745 1247 aa10.93□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 ICAM2P13598 275 aa10.93□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 ACVR2AP27037 513 aa10.93□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 CHRNA4P43681 627 aa10.93□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 HCAR3P49019 387 aa10.93□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 OCA2Q04671 838 aa10.93□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 SLC18A2Q05940 514 aa10.93□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 HSPA14Q0VDF9 509 aa10.93□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 WASHC5Q12768 1159 aa10.93□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 CCNG2Q16589 344 aa10.93□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 ATG16L1Q676U5 607 aa10.93□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 ADGRD1Q6QNK2 874 aa10.93□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 TMEM205Q6UW68 189 aa10.93□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 RNF111Q6ZNA4 994 aa10.93□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 CRLF3Q8IUI8 442 aa10.93□□□□□ -0.66
HCG18-241ENST00000602290 SHISA5Q8N114 240 aa10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms