RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589104.5

KDM4B-208, Transcript of lysine demethylase 4B, human

TSL 2

Gene KDM4B, Length 3,470 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KDM4B-208	ENST00000589104	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	SDE2	Q6IQ49	451 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	GAREM2	Q75VX8	874 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	OXR1	Q8N573	874 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	POC5	Q8NA72	575 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	SPC25	Q9HBM1	224 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	EVPLL	A8MZ36	301 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	HOXA2	O43364	376 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	CDK5	Q00535	292 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	ST3GAL4	Q11206	333 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	TWF1	Q12792	350 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	DUSP6	Q16828	381 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	IFI44L	Q53G44	452 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	VASN	Q6EMK4	673 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	NCLN	Q969V3	563 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	PKP4	Q99569	1192 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	BBS2	Q9BXC9	721 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	TNFRSF11B	O00300	401 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	IGSF6	O95976	241 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	ADA	P00813	363 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	ARHGEF7	Q14155	803 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	RGMB	Q6NW40	437 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	DPPA4	Q7L190	304 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	MORN4	Q8NDC4	146 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	TMEM169	Q96HH4	297 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	CFL2	Q9Y281	166 aa		12.79	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	TGFB1	P01137	390 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	ENPP1	P22413	925 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	SERPINA4	P29622	427 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	ARHGDIA	P52565	204 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	TMEM215	Q68D42	235 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	LILRA6	Q6PI73	481 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	HORMAD1	Q86X24	394 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	COQ10A	Q96MF6	247 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	EGFL8	Q99944	293 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	VPS4A	Q9UN37	437 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	FAM172BP	A6NC97	362 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104		J3KTA2	159 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	KIAA0513	O60268	411 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	CHRNE	Q04844	493 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	SYT12	Q8IV01	421 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	AMER2	Q8N7J2	671 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	MARK1	Q9P0L2	795 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	ZW10	O43264	779 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	KLF4	O43474	513 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	SCO1	O75880	301 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	LRAT	O95237	230 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	C1orf105	O95561	183 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	CTSL	P07711	333 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	PRKACA	P17612	351 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	CYP2A7	P20853	494 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	12.78	□□□□□ -0.36	1e-6	■■■■□ 24.7
KDM4B-208	ENST00000589104	OR1D2	P34982	312 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	DSG2	Q14126	1118 aa		12.78	□□□□□ -0.36
KDM4B-208	ENST00000589104	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36

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