RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567594.1

SSSCA1-AS1-201, Transcript of SSSCA1 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

BASIC

Gene SSSCA1-AS1, Length 614 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 IKBIPQ70UQ0 350 aa22.12■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SPACA3Q8IXA5 215 aa22.12■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 FNDC5Q8NAU1 212 aa22.12■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ACTRT2Q8TDY3 377 aa22.12■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 METTL21AQ8WXB1 218 aa22.12■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CRB3Q9BUF7 120 aa22.12■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 TRIM55Q9BYV6 548 aa22.12■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 AKTIPQ9H8T0 292 aa22.12■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 LANCL2Q9NS86 450 aa22.12■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 WDR70Q9NW82 654 aa22.12■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ASIC5Q9NY37 505 aa22.12■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 MKL2Q9ULH7 1088 aa22.12■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 C1orf226A1L170 272 aa22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 IDSB3KWA1 339 aa22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SDHDO14521 159 aa22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 PRMT3O60678 531 aa22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CTNSO60931 367 aa22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 GBAP04062 536 aa22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 JUNP05412 331 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 NR2F6P10588 404 aa22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 LBPP18428 481 aa22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 F8A1P23610 371 aa22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ASMTP46597 345 aa22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ERVK-8P63133 956 aa22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 RPL38P63173 70 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 MINDY4Q4G0A6 757 aa22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 OGFOD2Q6N063 350 aa22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 RAB43Q86YS6 212 aa22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CEP70Q8NHQ1 597 aa22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 STARD8Q92502 1023 aa22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 TM4SF18Q96CE8 201 aa22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 IL17BQ9UHF5 180 aa22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 C3orf18Q9UK00 162 aa22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 PSME2Q9UL46 239 aa22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 MAPRE3Q9UPY8 281 aa22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ATG4BQ9Y4P1 393 aa22.11■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa22.1■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ZNF195O14628 629 aa22.1■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 B4GALT2O60909 372 aa22.1■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ATXN8OSP0DMR3 200 aa22.1■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 DDX5P17844 614 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 MMP11P24347 488 aa22.1■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 MFSD4BQ5TF39 518 aa22.1■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 EPGNQ6UW88 154 aa22.1■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ACAD11Q709F0 780 aa22.1■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SPATA19Q7Z5L4 167 aa22.1■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 VASH2Q86V25 355 aa22.1■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 C16orf78Q8WTQ4 265 aa22.1■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 DCBLD2Q96PD2 775 aa22.1■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CEP295Q9C0D2 2601 aa22.1■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 MYNNQ9NPC7 610 aa22.1■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 RAXQ9Y2V3 346 aa22.1■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SCN3AQ9NY46 2000 aa22.09■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 A0A1W2PR48 441 aa22.09■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 TAS2R50P59544 299 aa22.09■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 UGT8Q16880 541 aa22.09■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa22.09■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 OR52E8Q6IFG1 317 aa22.09■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 LAPTM4BQ86VI4 370 aa22.09■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa22.09■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 FAM47BQ8NA70 645 aa22.09■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 PPP1R36Q96LQ0 422 aa22.09■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 VN1R1Q9GZP7 353 aa22.09■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 EHD3Q9NZN3 535 aa22.09■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa22.09■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa22.09■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 FER1L5A0AVI2 2057 aa22.09■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 FAM227AF5H4B4 570 aa22.08■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ALOX12BO75342 701 aa22.08■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 JRKO75564 520 aa22.08■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 UMODP07911 640 aa22.08■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 BCKDHAP12694 445 aa22.08■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 RHAGQ02094 409 aa22.08■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 TLE3Q04726 772 aa22.08■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SLC13A2Q13183 592 aa22.08■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SERTAD2Q14140 314 aa22.08■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ERV3-1Q14264 604 aa22.08■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CCDC81Q6ZN84 652 aa22.08■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 PRSS58Q8IYP2 241 aa22.08■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 THAP4Q8WY91 577 aa22.08■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CHMP6Q96FZ7 201 aa22.08■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 PTCHD1Q96NR3 888 aa22.08■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 CCDC28BQ9BUN5 200 aa22.08■■□□□ 1.13
SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 EBPLQ9BY08 206 aa22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms