RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957		E9PMD0	336 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957		F8VVB4	439 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957		F8VWA3	439 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	STMND1	H3BQB6	276 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SGK494	L7N484	410 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957		M0R296	226 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	EXTL3	O43909	919 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RPS6KA5	O75582	802 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT36	O76013	467 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RGS11	O94810	467 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CAVIN2	O95810	425 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MBD3	O95983	291 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	GSR	P00390	522 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	EGF	P01133	1207 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF12	P17014	697 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CKMT2	P17540	419 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	S1PR1	P21453	382 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CA8	P35219	290 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	GRIA1	P42261	906 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RGS4	P49798	205 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CCL11	P51671	97 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CDH4	P55283	916 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	FOXM1	Q08050	763 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TROAP	Q12815	778 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SELPLG	Q14242	412 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	HNF4G	Q14541	408 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	HLF	Q16534	295 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RBBP7	Q16576	425 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MAPK6	Q16659	721 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	USH1G	Q495M9	461 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	LIN9	Q5TKA1	542 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TTC23	Q5W5X9	447 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ALS2CL	Q60I27	953 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC5A8	Q8N695	610 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TRPV1	Q8NER1	839 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SMPDL3B	Q92485	455 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	STARD8	Q92502	1023 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SUSD6	Q92537	303 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM18	Q96B42	140 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MTERF3	Q96E29	417 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MAGED4	Q96JG8	741 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	C7orf34	Q96L11	122 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SGK494	Q96LW2	274 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM20A	Q96MK3	541 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CASD1	Q96PB1	797 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	NACA2	Q9H009	215 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	GAN	Q9H2C0	597 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	KLHL31	Q9H511	634 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ACTL8	Q9H568	366 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957		Q9N2K0	584 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	NOX4	Q9NPH5	578 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	C1RL	Q9NZP8	487 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		2.58	□□□□□ -2

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