RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 CDKL2Q92772 493 aa7.58□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 SGCZQ96LD1 299 aa7.58□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 KCNC2Q96PR1 638 aa7.58□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 F2RL3Q96RI0 385 aa7.58□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 FAM173AQ9BQD7 235 aa7.58□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 TBCDQ9BTW9 1192 aa7.58□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 EFCAB11Q9BUY7 163 aa7.58□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 OR8D2Q9GZM6 311 aa7.58□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 LYRM4Q9HD34 91 aa7.58□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 PRDM7Q9NQW5 492 aa7.58□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 DEPPQ9NTK1 212 aa7.58□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 WWOXQ9NZC7 414 aa7.58□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 CD274Q9NZQ7 290 aa7.58□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 VTI1BQ9UEU0 232 aa7.58□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 CLDN16Q9Y5I7 305 aa7.58□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 SPACA6W5XKT8 324 aa7.58□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 FBN2P35556 2912 aa7.58□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 OR14I1A6ND48 311 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 TMEM200CA6NKL6 621 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 FAM166BA8MTA8 275 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 C17orf105B2RV13 164 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 NPIPA2E9PIF3 369 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 NPIPA3F8WFD2 350 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 OR6B1O95007 311 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 S100BP04271 92 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 P04436 131 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 COX7A2P14406 83 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 STMN1P16949 149 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 CERS1P27544 350 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 SOX3P41225 446 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 CASP2P42575 452 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 HSPA7P48741 367 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 KRTAP10-9P60411 292 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 ATP6V0D1P61421 351 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 GNG11P61952 73 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 RNF4P78317 190 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 IRF8Q02556 426 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 CBLBQ13191 982 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 CHIT1Q13231 466 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 BIKQ13323 160 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 SLC10A1Q14973 349 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 TBCCQ15814 346 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 ZNF750Q32MQ0 723 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 TMEM35AQ53FP2 167 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 EMC4Q5J8M3 183 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 OPN5Q6U736 354 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 RTL4Q6ZR62 310 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 GK5Q6ZS86 529 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 CAPN12Q6ZSI9 719 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 FAM47EQ6ZV65 393 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 CYS1Q717R9 158 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 CDH24Q86UP0 819 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 MARVELD2Q8N4S9 558 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 ACOT4Q8N9L9 421 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 ACBD4Q8NC06 268 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 OR2M7Q8NG81 312 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 OR14A16Q8NHC5 309 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 UBE2E3Q969T4 207 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 ESAMQ96AP7 390 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 RASL10BQ96S79 203 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 KRT12Q99456 494 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 MCMBPQ9BTE3 642 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 UCK2Q9BZX2 261 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 COPS7AQ9UBW8 275 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 ACAD8Q9UKU7 415 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 RNF6Q9Y252 685 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 SNX24Q9Y343 169 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 SAR1BQ9Y6B6 198 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa7.57□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 NKX2-6A6NCS4 301 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 FIGNL2A6NMB9 653 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 G3V3Y1 287 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 BCKDKO14874 412 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 TP73O15350 636 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 DYRK3O43781 588 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 SUSD5O60279 629 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 PRAMEF4O60810 478 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 LDB3O75112 727 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 PIAS1O75925 651 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 TOXO94900 526 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 CPN2P22792 545 aa7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
COCH-211ENST00000557065 SPRP35270 261 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms