RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	MMP25	Q9NPA2	562 aa		10.53	□□□□□ -0.72
TPCN1-223	ENST00000552985	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		10.53	□□□□□ -0.72
TPCN1-223	ENST00000552985	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	10.53	□□□□□ -0.72
TPCN1-223	ENST00000552985	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		10.53	□□□□□ -0.72
TPCN1-223	ENST00000552985	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A0A6YYD5	115 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985		A8MUI8	341 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	CLDN4	O14493	209 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	TMPRSS11D	O60235	418 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	PLIN3	O60664	434 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	CTNS	O60931	367 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	LDB3	O75112	727 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	WDPCP	O95876	746 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	PDYN	P01213	254 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	GBA	P04062	536 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	UQCRH	P07919	91 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	MYL2	P10916	166 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	CPN2	P22792	545 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	CRHR1	P34998	444 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF33B	Q06732	778 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	IFT88	Q13099	833 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	C18orf63	Q68DL7	685 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	TRABD2A	Q86V40	505 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	CNPY4	Q8N129	248 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	ELP5	Q8TE02	316 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF382	Q96SR6	550 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	HBEGF	Q99075	208 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	CENPK	Q9BS16	269 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	STMN3	Q9NZ72	180 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	RAB21	Q9UL25	225 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	PPT2	Q9UMR5	302 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		10.52	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	MANBA	O00462	879 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	COPE	O14579	308 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	MYO1D	O94832	1006 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	CCT5	P48643	541 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	HTR6	P50406	440 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	AP2B1	P63010	937 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	ARG2	P78540	354 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	TNFRSF17	Q02223	184 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	RCN2	Q14257	317 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	ACER2	Q5QJU3	275 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	GPR180	Q86V85	440 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	BEST3	Q8N1M1	668 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	MREG	Q8N565	214 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	HAS2	Q92819	552 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	UCN3	Q969E3	161 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	KCNA7	Q96RP8	456 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	SERPINI1	Q99574	410 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	ASB4	Q9Y574	426 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	FLNC	Q14315	2725 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	RELN	P78509	3460 aa		10.51	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A1W2PR48	441 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	DYTN	A2CJ06	578 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	GLOD5	A6NK44	160 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	PROM1	O43490	865 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	FGF17	O60258	216 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	SEMA3D	O95025	777 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	IFNA16	P05015	189 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	KLK1	P06870	262 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		10.5	□□□□□ -0.73

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