RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM233	B4DJY2	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636		K7ERI5	159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	F2RL2	O00254	374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	RAD51B	O15315	384 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	MED7	O43513	233 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	KLRC4	O43908	158 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	GUCY1B2	O75343	617 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	KLHL2	O95198	593 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	OTC	P00480	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	MT-ATP6	P00846	226 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	AHSG	P02765	367 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	GYPC	P04921	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	FYN	P06241	537 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	IVL	P07476	585 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ABHD2	P08910	425 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SRC	P12931	536 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ERCC2	P18074	760 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CYP2A7	P20853	494 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	LMO2	P25791	158 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	IL1R2	P27930	398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SERPINA4	P29622	427 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PTGS2	P35354	604 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ARHGAP25	P42331	645 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	FASLG	P48023	281 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	STAR	P49675	285 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TAF6	P49848	677 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CCL11	P51671	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	EFNA5	P52803	228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SOX8	P57073	446 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	GCNT1	Q02742	428 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TUBA3C	Q13748	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	LIPM	Q5VYY2	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	VSTM1	Q6UX27	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CUZD1	Q86UP6	607 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SFR1	Q86XK3	245 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	DAW1	Q8N136	415 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC35F6	Q8N357	371 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	OR56A3	Q8NH54	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	RSC1A1	Q92681	617 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TFAP2C	Q92754	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	FBXO32	Q969P5	355 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TMCO6	Q96DC7	493 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ELP4	Q96EB1	424 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PSKH2	Q96QS6	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	HAPLN3	Q96S86	360 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	CTRC	Q99895	268 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	NDC1	Q9BTX1	674 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	THAP2	Q9H0W7	228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	APMAP	Q9HDC9	416 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	KLC4	Q9NSK0	619 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	RLIM	Q9NVW2	624 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	EHD2	Q9NZN4	543 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	RNF14	Q9UBS8	474 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	RAB21	Q9UL25	225 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	SNX6	Q9UNH7	406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TLCD2	A6NGC4	264 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	TTC34	A8MYJ7	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636		K7ERQ8	282 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-223	ENST00000523636	B4GAT1	O43505	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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