RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516162.1

RNU6-1333P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1333, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1333P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TRAV40A0A0B4J280 105 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 A6NDX4 124 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 C16orf90A8MZG2 172 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SP9P0CG40 484 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 F3P13726 295 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PDGFRAP16234 1089 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GJA1P17302 382 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CCNCP24863 283 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CLDN15P56746 228 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NUP107P57740 925 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RALGDSQ12967 914 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CUL3Q13618 768 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MED22Q15528 200 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IQCCQ4KMZ1 466 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PRR27Q6MZM9 219 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 Q8N9W7 124 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CCDC26Q8TAB7 109 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ST8SIA4Q92187 359 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RDH5Q92781 318 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LZTS2Q9BRK4 669 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ACTL8Q9H568 366 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NT5DC2Q9H857 520 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ERVW-1Q9UQF0 538 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LIPT2A6NK58 231 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IMPA2O14732 288 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BET1O15155 118 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TOMM70O94826 608 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RCBTB2O95199 551 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MBD4O95243 580 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IGHV4-34P06331 123 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FCGR3AP08637 254 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GOT1P17174 413 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GABRB1P18505 474 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CTNNA2P26232 953 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RGS2P41220 211 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CLDN17P56750 224 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RAET1LQ5VY80 246 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NEGR1Q7Z3B1 354 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF429Q86V71 674 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CADM2Q8N3J6 435 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FBXW8Q8N3Y1 598 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CCT6BQ92526 530 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HTRA1Q92743 480 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FRZBQ92765 325 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PROX1Q92786 737 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PGAM5Q96HS1 289 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HRH4Q9H3N8 390 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GLIPR2Q9H4G4 154 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SH2D4AQ9H788 454 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EQTNQ9NQ60 294 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EXD2Q9NVH0 621 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ACEP12821 1306 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GSAPA4D1B5 854 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LRRD1A4D1F6 860 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NKX2-6A6NCS4 301 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ANHXE9PGG2 379 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 J3QRE1 110 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RPS6KA5O75582 802 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CCDC159P0C7I6 412 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FOSL2P15408 326 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PPP2R1AP30153 589 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CTRLP40313 264 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TIMM10P62072 90 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ACTA1P68133 377 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PRAMEP78395 509 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ANKRD55Q3KP44 614 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR52W1Q6IF63 320 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DHRS11Q6UWP2 260 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SEPT1Q8WYJ6 367 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NDNQ99608 321 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SEPHS2Q99611 448 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NICN1Q9BSH3 213 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OPA3Q9H6K4 179 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MMP26Q9NRE1 261 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SVILO95425 2214 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TRAV24A0A0B4J272 114 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 A0A1W2PPQ1 181 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RNF212BA8MTL3 300 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CDRT15L2A8MXV6 281 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TMCO5BA8MYB1 307 aa-0.31□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms