RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504958.6

ANKRD55-203, Transcript of ankyrin repeat domain 55, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ANKRD55, Length 2,139 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55-203ENST00000504958 SPIN4Q56A73 249 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 CEP78Q5JTW2 689 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 SAXO2Q658L1 398 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 GRHL2Q6ISB3 625 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 ZNF852Q6ZMS4 543 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 OXR1Q8N573 874 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 DCAF4L2Q8NA75 395 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 SLC43A3Q8NBI5 491 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 DIRAS2Q96HU8 199 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 DEFB118Q96PH6 123 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 IL4I1Q96RQ9 567 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 SLC35A5Q9BS91 424 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 MED18Q9BUE0 208 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 TRIM39Q9HCM9 518 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 REV1Q9UBZ9 1251 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 SNX11Q9Y5W9 270 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 KIAA1671Q9BY89 1806 aa9.3□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 PROM1O43490 865 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 TBL1XO60907 577 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 CDRT1O95170 752 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 HLA-DQB1P01920 261 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 SRCP12931 536 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 OSMP13725 252 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 POU1F1P28069 291 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 PKLRP30613 574 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 HTR2BP41595 481 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 QPRTQ15274 297 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 GPR19Q15760 415 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 DDI2Q5TDH0 399 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 C12orf73Q69YU5 71 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 TRIM40Q6P9F5 258 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 CRTC1Q6UUV9 634 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 LYPD8Q6UX82 237 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 TSPAN33Q86UF1 283 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 TRIM48Q8IWZ4 208 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 YIPF7Q8N8F6 280 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 WBP2Q969T9 261 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 FAM83DQ9H4H8 585 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 DIABLOQ9NR28 239 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 TOR4AQ9NXH8 423 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 A0A0X1KG70 313 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 A8MX80 341 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 E7EQ34 232 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 WWP2O00308 870 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 PLD2O14939 933 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 KPNA5O15131 536 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 ARHGEF9O43307 516 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 PDE9AO76083 593 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 RECKO95980 971 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 C1QBP02746 253 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 IFNW1P05000 195 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 TSPAN19P0C672 248 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 CPEP16870 476 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 GPC1P35052 558 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 IRS1P35568 1242 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 NUDT1P36639 197 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 CSKP41240 450 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 OR3A3P47888 321 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 SLC9A3P48764 834 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 CASP9P55211 416 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 C1DQ13901 141 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 GANABQ14697 944 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 OCLNQ16625 522 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 CYP27C1Q4G0S4 372 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 ZNF385BQ569K4 471 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 ZNF628Q5EBL2 1059 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 MFSD4BQ5TF39 518 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 LIPKQ5VXJ0 399 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 RETSATQ6NUM9 610 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 FAM217AQ8IXS0 508 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 DUSP18Q8NEJ0 188 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 OR4K1Q8NGD4 311 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 OR8J1Q8NGP2 316 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 ENKURQ8TC29 256 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 SUN5Q8TC36 379 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 UBASH3BQ8TF42 649 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 SLC6A18Q96N87 628 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 BEX2Q9BXY8 128 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 UCK2Q9BZX2 261 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 RNF208Q9H0X6 261 aa9.29□□□□□ -0.92
ANKRD55-203ENST00000504958 REEP4Q9H6H4 257 aa9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms