RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503668.1

HULC-201, hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HULC, Length 556 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HULC-201ENST00000503668 SLC5A8Q8N695 610 aa8.97□□□□□ -0.97
HULC-201ENST00000503668 PROKR2Q8NFJ6 384 aa8.97□□□□□ -0.97
HULC-201ENST00000503668 OR8J1Q8NGP2 316 aa8.97□□□□□ -0.97
HULC-201ENST00000503668 OR6F1Q8NGZ6 308 aa8.97□□□□□ -0.97
HULC-201ENST00000503668 OR56A3Q8NH54 315 aa8.97□□□□□ -0.97
HULC-201ENST00000503668 ZNF461Q8TAF7 563 aa8.97□□□□□ -0.97
HULC-201ENST00000503668 FIBINQ8TAL6 211 aa8.97□□□□□ -0.97
HULC-201ENST00000503668 SPPL2AQ8TCT8 520 aa8.97□□□□□ -0.97
HULC-201ENST00000503668 GPR152Q8TDT2 470 aa8.97□□□□□ -0.97
HULC-201ENST00000503668 KLHL6Q8WZ60 621 aa8.97□□□□□ -0.97
HULC-201ENST00000503668 AP3S1Q92572 193 aa8.97□□□□□ -0.97
HULC-201ENST00000503668 HTRA1Q92743 480 aa8.97□□□□□ -0.97
HULC-201ENST00000503668 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
HULC-201ENST00000503668 CASD1Q96PB1 797 aa8.97□□□□□ -0.97
HULC-201ENST00000503668 MND1Q9BWT6 205 aa8.97□□□□□ -0.97
HULC-201ENST00000503668 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa8.97□□□□□ -0.97
HULC-201ENST00000503668 SLC22A4Q9H015 551 aa8.97□□□□□ -0.97
HULC-201ENST00000503668 MYNNQ9NPC7 610 aa8.97□□□□□ -0.97
HULC-201ENST00000503668 NMRK2Q9NPI5 230 aa8.97□□□□□ -0.97
HULC-201ENST00000503668 KCND3Q9UK17 655 aa8.97□□□□□ -0.97
HULC-201ENST00000503668 TMCC3Q9ULS5 477 aa8.97□□□□□ -0.97
HULC-201ENST00000503668 ICKQ9UPZ9 632 aa8.97□□□□□ -0.97
HULC-201ENST00000503668 ACTL7AQ9Y615 435 aa8.97□□□□□ -0.97
HULC-201ENST00000503668 KCNE2Q9Y6J6 123 aa8.97□□□□□ -0.97
HULC-201ENST00000503668 DSPPQ9NZW4 1301 aa8.97□□□□□ -0.97
HULC-201ENST00000503668 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa8.97□□□□□ -0.97
HULC-201ENST00000503668 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa8.96□□□□□ -0.97
HULC-201ENST00000503668 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 FAAHO00519 579 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 SCO2O43819 266 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 PRAMEF12O95522 483 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 IFNW1P05000 195 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 GALTP07902 379 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 YES1P07947 543 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 STSP08842 583 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 ALPIP09923 528 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 LAMP1P11279 417 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 CKMT1AP12532 417 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 CFL1P23528 166 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 HLA-DMAP28067 261 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 CSKP41240 450 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 SPINT3P49223 89 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 SPIBQ01892 262 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 ZNF763Q0D2J5 394 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 SLC14A1Q13336 389 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 GPR50Q13585 617 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 SCARB2Q14108 478 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 DMC1Q14565 340 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 TMEM44Q2T9K0 475 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 ARMC4Q5T2S8 1044 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 MED27Q6P2C8 311 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 BRAT1Q6PJG6 821 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 CD300LDQ6UXZ3 194 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 PTCHD4Q6ZW05 846 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 HTR3DQ70Z44 454 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 C16orf59Q7L2K0 433 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 ATCAYQ86WG3 371 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 SLC43A3Q8NBI5 491 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 GPR26Q8NDV2 337 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 B3GNT7Q8NFL0 401 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 OR4A15Q8NGL6 344 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 LINC01599Q8WXQ3 324 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 TMEM80Q96HE8 168 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 KCNC2Q96PR1 638 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 CLSTN3Q9BQT9 956 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 SYT17Q9BSW7 474 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 GON7Q9BXV9 100 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 TPK1Q9H3S4 243 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 SLC25A19Q9HC21 320 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 SMURF1Q9HCE7 757 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 C1GALT1Q9NS00 363 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 SACM1LQ9NTJ5 587 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 ACER3Q9NUN7 267 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 MS4A12Q9NXJ0 267 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 AHSPQ9NZD4 102 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 SH3BP4Q9P0V3 963 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 FTSJ1Q9UET6 329 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 POU2F3Q9UKI9 436 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 SSR3Q9UNL2 185 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 SLC22A14Q9Y267 594 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 HS3ST2Q9Y278 367 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 ITM2BQ9Y287 266 aa8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa8.95□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 WASH3PC4AMC7 463 aa8.95□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 PROM1O43490 865 aa8.95□□□□□ -0.98
HULC-201ENST00000503668 TSPAN3O60637 253 aa8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms