RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490302.1

PKDCC-208, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 2

Gene PKDCC, Length 1,447 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-208ENST00000490302 FAM155BO75949 473 aa16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 WDR47O94967 919 aa16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 CELA3AP09093 270 aa16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 TNNI3P19429 210 aa16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 GSTM2P28161 218 aa16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 PEX19P40855 299 aa16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 PLA2G16P53816 162 aa16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 LIM2P55344 173 aa16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 CDKL1Q00532 357 aa16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 FOXO1Q12778 655 aa16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 RCN2Q14257 317 aa16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 TRIM40Q6P9F5 258 aa16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF321PQ8N8H1 164 aa16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 OR2L5Q8NG80 312 aa16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 OR5L2Q8NGL0 311 aa16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 OR8K3Q8NH51 312 aa16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 GRK7Q8WTQ7 553 aa16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 MS4A14Q96JA4 679 aa16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 PWWP2AQ96N64 755 aa16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 CSF3RQ99062 836 aa16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 RASSF1Q9NS23 344 aa16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 B4GALT7Q9UBV7 327 aa16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 VTI1BQ9UEU0 232 aa16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 DAPP1Q9UN19 280 aa16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PKDCC-208ENST00000490302 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa16.08■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa16.08■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 ANKDD1BA6NHY2 528 aa16.08■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 PROM1O43490 865 aa16.08■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 HCN1O60741 890 aa16.08■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 CLEC3AO75596 197 aa16.08■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 GABRA1P14867 456 aa16.08■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 CERS1P27544 350 aa16.08■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 HPDP32754 393 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 HNMTP50135 292 aa16.08■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 MTTPP55157 894 aa16.08■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 RNF4P78317 190 aa16.08■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 STX4Q12846 297 aa16.08■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.161e-10■■■■■ 39.2
PKDCC-208ENST00000490302 KRT78Q8N1N4 520 aa16.08■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 ANKRD7Q92527 254 aa16.08■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 CNPPD1Q9BV87 410 aa16.08■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 NT5DC2Q9H857 520 aa16.08■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 ATG4BQ9Y4P1 393 aa16.08■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 OARD1Q9Y530 152 aa16.08■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 C17orf105B2RV13 164 aa16.07■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 CCL3P10147 92 aa16.07■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 DRD2P14416 443 aa16.07■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 UQCRC1P31930 480 aa16.07■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 GDF5P43026 501 aa16.07■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 ADPRMQ3LIE5 342 aa16.07■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 MSS51Q4VC12 460 aa16.07■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 FRA10AC1Q70Z53 315 aa16.07■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 IGDCC3Q8IVU1 814 aa16.07■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 SLC2A12Q8TD20 617 aa16.07■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 SLCO2A1Q92959 643 aa16.07■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 PBKQ96KB5 322 aa16.07■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 CRIM1Q9NZV1 1036 aa16.07■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 FOSL1P15407 271 aa16.06■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 DGKQP52824 942 aa16.06■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 SERTAD2Q14140 314 aa16.06■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 PPP1R7Q15435 360 aa16.06■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 ABHD17CQ6PCB6 329 aa16.06■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 GAS2L3Q86XJ1 694 aa16.06■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 CDC20BQ86Y33 519 aa16.06■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 KIAA1191Q96A73 305 aa16.06■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 ALPK1Q96QP1 1244 aa16.06■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 CAPS2Q9BXY5 557 aa16.06■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 DLL4Q9NR61 685 aa16.06■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 SPRR3Q9UBC9 169 aa16.06■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 COPS7AQ9UBW8 275 aa16.06■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 HSPB2A8KAH6 182 aa16.05■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 SYT5O00445 386 aa16.05■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 PIGAP37287 484 aa16.05■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 SLC6A12P48065 614 aa16.05■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 FNTAP49354 379 aa16.05■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 TGM3Q08188 693 aa16.05■□□□□ 0.16
PKDCC-208ENST00000490302 HSPB2Q16082 182 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms