RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484178.5

SSBP1-211, Transcript of single stranded DNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene SSBP1, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1-211ENST00000484178 TMEM247A6NEH6 219 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 SMCHD1A6NHR9 2005 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 CLDN24A6NM45 220 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 G3V2T6 193 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 J3KTA2 159 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 M0QZ92 97 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 M0R3G1 203 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 FXYD1O00168 92 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 PLK4O00444 970 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 DLGAP1O14490 977 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 EI24O14681 340 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 RGS14O43566 566 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 PRAMEF10O60809 474 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 USP12O75317 370 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 VPS26AO75436 327 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 CNMDO75829 334 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 CDK14O94921 469 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 PTTG1O95997 202 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 OTCP00480 354 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 VTNP04004 478 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 ALPLP05186 524 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 FYNP06241 537 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 DPEP1P16444 411 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 CKMT2P17540 419 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 GGT1P19440 569 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 TYMPP19971 482 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 IL11P20809 199 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 SAT1P21673 171 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 CRHBPP24387 322 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 SERPINA4P29622 427 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 SERPINB1P30740 379 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 PCYT1AP49585 367 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 TTPAP49638 278 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 ERFP50548 548 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 HUNKP57058 714 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 DEFA1P59665 94 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 DEFA3P59666 94 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 TSPY1Q01534 308 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 ZNF45Q02386 682 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 IL10RBQ08334 325 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 SMARCB1Q12824 385 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 TRAF2Q12933 501 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 RALGDSQ12967 914 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 PMS2P3Q13401 168 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 PEX6Q13608 980 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 SEMA3AQ14563 771 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 POU6F1Q14863 301 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 GPR68Q15743 365 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 RAB6CQ53S08 254 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 C6orf141Q5SZD1 244 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 TREML2Q5T2D2 321 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 ZNF618Q5T7W0 954 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 DEPDC1Q5TB30 811 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 MLIPQ5VWP3 458 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 SYPL2Q5VXT5 272 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 TAPT1Q6NXT6 567 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 ERICH5Q6P6B1 374 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 FAM171BQ6P995 826 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 CERS6Q6ZMG9 384 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 LRRC8DQ7L1W4 858 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 SYT13Q7L8C5 426 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 MON1AQ86VX9 555 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 ZFAND4Q86XD8 727 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 EPHX4Q8IUS5 362 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 FUNDC1Q8IVP5 155 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 CEP97Q8IW35 865 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 GPC2Q8N158 579 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 NPWQ8N729 165 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 RNF148Q8N7C7 305 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 TMIEQ8NEW7 156 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 OR7A2PQ8NGA2 310 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 HMGCLL1Q8TB92 370 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 CLEC4CQ8WTT0 213 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 SLC22A17Q8WUG5 538 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 RORBQ92753 470 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 BIRC7Q96CA5 298 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 RADILQ96JH8 1075 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 GLT1D1Q96MS3 346 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 RNF145Q96MT1 663 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 DACH2Q96NX9 599 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 MOGAT1Q96PD6 335 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 NODALQ96S42 347 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 FUZQ9BT04 418 aa4.59□□□□□ -1.67
SSBP1-211ENST00000484178 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms