RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 A0A0A6YYD5 115 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 SAGE2PA6NJ88 616 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 TTLL8A6PVC2 850 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 SEMA3DO95025 777 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 MLYCDO95822 493 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 PDYNP01213 254 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 TUBBP07437 444 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 CPN2P22792 545 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 PPP2R1BP30154 601 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 LCP2Q13094 533 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 CDYL2Q8N8U2 506 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 DNAJB14Q8TBM8 379 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 SELENOMQ8WWX9 145 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 KCNK13Q9HB14 408 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 SLAMF7Q9NQ25 335 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 OXSMQ9NWU1 459 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 MKS1Q9NXB0 559 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 PLA2G3Q9NZ20 509 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 SNX6Q9UNH7 406 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 PLLPQ9Y342 182 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 ATG4BQ9Y4P1 393 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 SPACA6W5XKT8 324 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 BLACEA4D250 179 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 A8MUI8 341 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 MANBAO00462 879 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 TMPRSS11DO60235 418 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 CPA3P15088 417 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 DNAJB13P59910 316 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 IGFBP7Q16270 282 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 CUZD1Q86UP6 607 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 GPR180Q86V85 440 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 NUDT13Q86X67 352 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 EFCAB3Q8N7B9 438 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 CCNYL1Q8N7R7 359 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 CATSPER1Q8NEC5 780 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 HAS2Q92819 552 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 APOPT1Q96IL0 206 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 NPAS2Q99743 824 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 SLC29A3Q9BZD2 475 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 MS4A12Q9NXJ0 267 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 STK38LQ9Y2H1 464 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 ASB4Q9Y574 426 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 NBASA2RRP1 2371 aa19.59■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa19.59■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 PROM1O43490 865 aa19.59■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 LDB3O75112 727 aa19.59■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 DEKP35659 375 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 NAGLUP54802 743 aa19.59■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 PKNOX1P55347 436 aa19.59■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 FOXK1P85037 733 aa19.59■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 TERF2Q15554 542 aa19.59■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 C18orf63Q68DL7 685 aa19.59■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 METTL4Q8N3J2 472 aa19.59■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 KIF2BQ8N4N8 673 aa19.59■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 CCDC63Q8NA47 563 aa19.59■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 CPT1CQ8TCG5 803 aa19.59■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 AGAP11Q8TF27 550 aa19.59■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 MIB2Q96AX9 1013 aa19.59■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 ZNF354BQ96LW1 612 aa19.59■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 BRF2Q9HAW0 419 aa19.59■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 STMN3Q9NZ72 180 aa19.59■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 PHF11Q9UIL8 331 aa19.59■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 MAN1A2O60476 641 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 MYO1DO94832 1006 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 WISP1O95388 367 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 ESRRBO95718 433 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 WDPCPO95876 746 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 GBAP04062 536 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 UQCRHP07919 91 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 GPR143P51810 404 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 NAA20P61599 178 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 ARG2P78540 354 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 TNFRSF17Q02223 184 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 ZNF33BQ06732 778 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 ZNF844Q08AG5 666 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 STX4Q12846 297 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 ABHD17BQ5VST6 288 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 FCRLBQ6BAA4 426 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 CYP20A1Q6UW02 462 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 CRLF3Q8IUI8 442 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 APCDD1LQ8NCL9 501 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 B3GNT7Q8NFL0 401 aa19.58■□□□□ 0.72
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