RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469793.1

RAD18-208, Transcript of RAD18, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 2

Gene RAD18, Length 592 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD18-208	ENST00000469793	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	RAX	Q9Y2V3	346 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	SCN2A	Q99250	2005 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793		A0A087WV48	116 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	IDS	B3KWA1	339 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	TAF4	O00268	1085 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	PROM1	O43490	865 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	JRK	O75564	520 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	IGHE	P01854	428 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	UMOD	P07911	640 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	NR2F6	P10588	404 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	CPN2	P22792	545 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	MAPK1	P28482	360 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	RHAG	Q02094	409 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	OGFOD2	Q6N063	350 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	FAM47B	Q8NA70	645 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	CRB3	Q9BUF7	120 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	EBPL	Q9BY08	206 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	MYNN	Q9NPC7	610 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	C3orf18	Q9UK00	162 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793		A0A1W2PR48	441 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	CLDN4	O14493	209 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	PEX11A	O75192	247 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	CREG1	O75629	220 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	AIFM1	O95831	613 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	SDC1	P18827	310 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	EFNA3	P52797	238 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	HSD17B7	P56937	341 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	FOXL2	P58012	376 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	ERVK-8	P63133	956 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	MC1R	Q01726	317 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	TLE3	Q04726	772 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	EMX2	Q04743	252 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	ERV3-1	Q14264	604 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	SSPN	Q14714	243 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	BROX	Q5VW32	411 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	EPGN	Q6UW88	154 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	TANK	Q92844	425 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	WDR41	Q9HAD4	459 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793		A0A1W2PQ72	361 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	C1orf226	A1L170	272 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	FAM227A	F5H4B4	570 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	PRMT3	O60678	531 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	B4GALT2	O60909	372 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	ALOX12B	O75342	701 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	HEXB	P07686	556 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	PRPS2	P11908	318 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	BCKDHA	P12694	445 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RAD18-208	ENST00000469793	DRD2	P14416	443 aa		13.53	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79 ms