RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 NSA2O95478 260 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 KLK1P06870 262 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 VIMP08670 466 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 TCN2P20062 427 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 AGXTP21549 392 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 FBLP22087 321 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 CD82P27701 267 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 BSGP35613 385 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 MTTPP55157 894 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 SLAMF1Q13291 335 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 MAP7Q14244 749 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 ERV3-1Q14264 604 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 GALNTL6Q49A17 601 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 PRMT9Q6P2P2 845 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 RGS9BPQ6ZS82 235 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 RNF165Q6ZSG1 346 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 Q6ZSR9 355 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 COX15Q7KZN9 410 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 COMMD6Q7Z4G1 85 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM151BQ8IW70 566 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 PRSS58Q8IYP2 241 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 LRRC34Q8IZ02 419 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 CA13Q8N1Q1 262 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 ESX1Q8N693 406 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 ACOT4Q8N9L9 421 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 OR51Q1Q8NH59 317 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 CT55Q8WUE5 264 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 FGF11Q92914 225 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 NKD1Q969G9 470 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 MVB12AQ96EY5 273 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 PEX11GQ96HA9 241 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 KCNC2Q96PR1 638 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 SERINC2Q96SA4 455 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 CENPKQ9BS16 269 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 TBCDQ9BTW9 1192 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 EBPLQ9BY08 206 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 RBCK1Q9BYM8 510 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 NUF2Q9BZD4 464 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 ROGDIQ9GZN7 287 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 LRTM1Q9HBL6 345 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 NMRK1Q9NWW6 199 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 AHSPQ9NZD4 102 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 TRPC4Q9UBN4 977 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 CROTQ9UKG9 612 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 FBXW2Q9UKT8 454 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 URB1O60287 2271 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 APC2O95996 2303 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 ACACAQ13085 2346 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 AKAP13Q12802 2813 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A088AWK7 358 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A0A6YYD5 115 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 GOLGA8OA6NCC3 632 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 OR2W5A6NFC9 320 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM227AF5H4B4 570 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 GOLGA8NF8WBI6 632 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 H0YIG0 161 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 SDHDO14521 159 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF195O14628 629 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 LSM1O15116 133 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 HDAC3O15379 428 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 TMPRSS11DO60235 418 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 EDF1O60869 148 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 PEX11AO75192 247 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 TNFRSF21O75509 655 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 JRKO75564 520 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 SEMA3DO95025 777 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 ONECUT2O95948 504 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 C1QTNF9P0C862 333 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 LIPCP11150 499 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 F8A1P23610 371 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 DLSTP36957 453 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 STAT5AP42229 794 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 HK2P52789 917 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 LIM2P55344 173 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 RAE1P78406 368 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 ACSM2AQ08AH3 577 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 VWA2Q5GFL6 755 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 XKR7Q5GH72 579 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD28-208ENST00000463533 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.9 ms