RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 ICE1Q9Y2F5 2266 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0A6YYD5 115 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 TLDC2A0PJX2 215 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 SAGE2PA6NJ88 616 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 A8MUI8 341 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 HRKO00198 91 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PGRMC2O15173 223 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 B3GALT2O43825 422 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 UGDHO60701 494 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 SMIM24O75264 130 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 SCELO95171 688 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CLDN9O95484 217 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PDYNP01213 254 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CYC1P08574 325 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF224P0DH78 156 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CD46P15529 392 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 IMPDH1P20839 514 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 IL10P22301 178 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 GNLYP22749 145 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 GSTM2P28161 218 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PIK3CBP42338 1070 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 MTTPP55157 894 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXA1P55317 472 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CLCQ05315 142 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 SGO1Q5FBB7 561 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PAGE2BQ5JRK9 111 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR93Q6P2C0 686 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 TAOK1Q7L7X3 1001 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 C4orf33Q8N1A6 199 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 BEST3Q8N1M1 668 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ZADH2Q8N4Q0 377 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 APCDD1LQ8NCL9 501 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 DNAJB14Q8TBM8 379 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ACMSDQ8TDX5 336 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP4R1Q8TF05 950 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 METTL21AQ8WXB1 218 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 HAS2Q92819 552 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CMTM7Q96FZ5 175 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 SEC16BQ96JE7 1060 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 FAR2Q96K12 515 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNA7Q96RP8 456 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 HBEGFQ99075 208 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CDCP1Q9H5V8 836 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNK13Q9HB14 408 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 MMP25Q9NPA2 562 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD10Q9NXR5 420 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 POLEQ07864 2286 aa6.55□□□□□ -1.36
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RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PR48 441 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CLEC18AA5D8T8 446 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 GLOD5A6NK44 160 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 TCP11X1B4DZS4 312 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDH17O14917 1159 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PROM1O43490 865 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 FGF17O60258 216 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PLIN3O60664 434 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CTNSO60931 367 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 MYO1DO94832 1006 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 SUPT7LO94864 414 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 DDAH2O95865 285 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 GSTA1P08263 222 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 SERPINB3P29508 390 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 SOX18P35713 384 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CD96P40200 585 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 SSR2P43308 183 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 TNFSF10P50591 281 aa6.54□□□□□ -1.36
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RABGEF1-206ENST00000461017 PRKAA2P54646 552 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 HERVK_113P63132 956 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 RAE1P78406 368 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PRR20EP86478 221 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PRR20CP86479 221 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PRR20DP86480 221 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PRR20BP86481 221 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PRR20AP86496 221 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PMP22Q01453 160 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 DUSP2Q05923 314 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PRSS53Q2L4Q9 553 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF750Q32MQ0 723 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 GGTA1PQ4G0N0 100 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM35AQ53FP2 167 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 ACER2Q5QJU3 275 aa6.54□□□□□ -1.36
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