RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454561.2

TRBV5-4-201, Transcript of T cell receptor beta variable 5-4, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRBV5-4, Length 544 nt, Biotype TR V gene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-4-201ENST00000454561 PLA2G3Q9NZ20 509 aa7□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 LUZP4Q9P127 313 aa7□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 FBXW2Q9UKT8 454 aa7□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 GRID1Q9ULK0 1009 aa7□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 PPT2Q9UMR5 302 aa7□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 PLAAQ9Y263 795 aa7□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 COL12A1Q99715 3063 aa7□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 RELNP78509 3460 aa7□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 MPDZO75970 2070 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 TRAV17A0A0B4J275 112 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 FOXO6A8MYZ6 492 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 PPP6CO00743 305 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 PLPP1O14494 284 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 COPEO14579 308 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 GLRA3O75311 464 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 VPS4BO75351 444 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 SUPT7LO94864 414 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 WDPCPO95876 746 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 TSPAN8P19075 237 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 CPN2P22792 545 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 BSGP35613 385 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 TNFSF10P50591 281 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 PRKAA2P54646 552 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 SLC26A5P58743 744 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 TAS2R50P59544 299 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 CLCQ05315 142 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 ZNF33BQ06732 778 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 IFFO1Q0D2I5 559 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 IFT88Q13099 833 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 TRAF3Q13114 568 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 TERF2Q15554 542 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 MEP1AQ16819 746 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 GGTA1PQ4G0N0 100 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 UNC50Q53HI1 259 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 SGO1Q5FBB7 561 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 ACER2Q5QJU3 275 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 ZNF793Q6ZN11 406 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 CUZD1Q86UP6 607 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 GPR180Q86V85 440 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 SLC5A8Q8N695 610 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 AMER2Q8N7J2 671 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 FAM47BQ8NA70 645 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 GALNT11Q8NCW6 608 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 CATSPER1Q8NEC5 780 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 OR4F6Q8NGB9 312 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 ELP5Q8TE02 316 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 TRPC4APQ8TEL6 797 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 CNDP1Q96KN2 507 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 DEFB126Q9BYW3 111 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 RNF32Q9H0A6 362 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 ELOVL6Q9H5J4 265 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 AHSPQ9NZD4 102 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 ABI3Q9P2A4 366 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 MAP10Q9P2G4 905 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 VTI1BQ9UEU0 232 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 VPS4AQ9UN37 437 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 SNX6Q9UNH7 406 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 CSAG2Q9Y5P2 127 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 EXPH5Q8NEV8 1989 aa6.99□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 SAGE2PA6NJ88 616 aa6.98□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 CDK2AP1O14519 115 aa6.98□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 PROM1O43490 865 aa6.98□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 LDB3O75112 727 aa6.98□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 MYO1DO94832 1006 aa6.98□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 OR4F21O95013 312 aa6.98□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 SEMA3DO95025 777 aa6.98□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 ETHE1O95571 254 aa6.98□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 MLYCDO95822 493 aa6.98□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 KRT6AP02538 564 aa6.98□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 KRT6BP04259 564 aa6.98□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 IFNA16P05015 189 aa6.98□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 TUBBP07437 444 aa6.98□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 NUDT17P0C025 328 aa6.98□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 MYL2P10916 166 aa6.98□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 KRT4P19013 534 aa6.98□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 TNNI3P19429 210 aa6.98□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 KRT6CP48668 564 aa6.98□□□□□ -1.29
TRBV5-4-201ENST00000454561 CLCN2P51788 898 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms