RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420058.1

NFE4-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NFE4, Length 1,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE4-201ENST00000420058 GK5Q6ZS86 529 aa13.15□□□□□ -0.3
NFE4-201ENST00000420058 VN1R5Q7Z5H4 357 aa13.15□□□□□ -0.3
NFE4-201ENST00000420058 TMPRSS11BQ86T26 416 aa13.15□□□□□ -0.3
NFE4-201ENST00000420058 IGDCC3Q8IVU1 814 aa13.15□□□□□ -0.3
NFE4-201ENST00000420058 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP13.15□□□□□ -0.3
NFE4-201ENST00000420058 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa13.15□□□□□ -0.3
NFE4-201ENST00000420058 FAM47BQ8NA70 645 aa13.15□□□□□ -0.3
NFE4-201ENST00000420058 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
NFE4-201ENST00000420058 NAXEQ8NCW5 288 aa13.15□□□□□ -0.3
NFE4-201ENST00000420058 WFDC11Q8NEX6 87 aa13.15□□□□□ -0.3
NFE4-201ENST00000420058 GAL3ST3Q96A11 431 aa13.15□□□□□ -0.3
NFE4-201ENST00000420058 SH3GL2Q99962 352 aa13.15□□□□□ -0.3
NFE4-201ENST00000420058 CBLCQ9ULV8 474 aa13.15□□□□□ -0.3
NFE4-201ENST00000420058 VWA7Q9Y334 891 aa13.15□□□□□ -0.3
NFE4-201ENST00000420058 ATG4BQ9Y4P1 393 aa13.15□□□□□ -0.3
NFE4-201ENST00000420058 NINQ8N4C6 2090 aa13.15□□□□□ -0.3
NFE4-201ENST00000420058 CLDN4O14493 209 aa13.14□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 CTNSO60931 367 aa13.14□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 BANF1O75531 89 aa13.14□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 FREM3P0C091 2139 aa13.14□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 DRD2P14416 443 aa13.14□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 PIGAP37287 484 aa13.14□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 MAN2A2P49641 1150 aa13.14□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 LIM2P55344 173 aa13.14□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 RNF4P78317 190 aa13.14□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 LTBQ06643 244 aa13.14□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 BMPR2Q13873 1038 aa13.14□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 MSS51Q4VC12 460 aa13.14□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa13.14□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 LYPD8Q6UX82 237 aa13.14□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa13.14□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 ZNF595Q8IYB9 648 aa13.14□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa13.14□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 GOLM1Q8NBJ4 401 aa13.14□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 MORN4Q8NDC4 146 aa13.14□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 OR8K3Q8NH51 312 aa13.14□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 SGCZQ96LD1 299 aa13.14□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa13.14□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 TRIM54Q9BYV2 358 aa13.14□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 ALKBH4Q9NXW9 302 aa13.14□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 DYRK1BQ9Y463 629 aa13.14□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 KCNE2Q9Y6J6 123 aa13.14□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 CDC7O00311 574 aa13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 ERI3O43414 337 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 HCN1O60741 890 aa13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 ATE1O95260 518 aa13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 ETHE1O95571 254 aa13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 PGAM1P18669 254 aa13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 HOXC12P31275 282 aa13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 GDF5P43026 501 aa13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 PIGGQ5H8A4 983 aa13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 ADNP2Q6IQ32 1131 aa13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 ABHD17CQ6PCB6 329 aa13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 FAM47EQ6ZV65 393 aa13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 Q71RC1 249 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 UBE3DQ7Z6J8 389 aa13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 GALNT7Q86SF2 657 aa13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 ULK2Q8IYT8 1036 aa13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 ZNF721Q8TF20 911 aa13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 FAM222BQ8WU58 562 aa13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 SARAFQ96BY9 339 aa13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 FAR2Q96K12 515 aa13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 OR8D2Q9GZM6 311 aa13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 DMRT3Q9NQL9 472 aa13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 PRDM7Q9NQW5 492 aa13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 SACM1LQ9NTJ5 587 aa13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 DAPP1Q9UN19 280 aa13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 NCKAP5O14513 1909 aa13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 ARID1AO14497 2285 aa13.13□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa13.12□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 LRRC3CA6NJW4 275 aa13.12□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 B3GALT2O43825 422 aa13.12□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 SAT1P21673 171 aa13.12□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 CERS1P27544 350 aa13.12□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 UQCRC1P31930 480 aa13.12□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 SLC6A12P48065 614 aa13.12□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 DGKQP52824 942 aa13.12□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 PLA2G16P53816 162 aa13.12□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 CYP1B1Q16678 543 aa13.12□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 FLYWCH1Q4VC44 716 aa13.12□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 WLSQ5T9L3 541 aa13.12□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 PAMR1Q6UXH9 720 aa13.12□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa13.12□□□□□ -0.31
NFE4-201ENST00000420058 ZNF662Q6ZS27 426 aa13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms