RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417497.5

TTC28-AS1-202, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TTC28-AS1, Length 627 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-202ENST00000417497 BSGP35613 385 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CLCQ05315 142 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 RCN2Q14257 317 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TLR1Q15399 786 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ACER2Q5QJU3 275 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 H3F3CQ6NXT2 135 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 OR4N5Q8IXE1 308 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 C4orf33Q8N1A6 199 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ELP5Q8TE02 316 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 HBEGFQ99075 208 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PPCSQ9HAB8 311 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ANKRD10Q9NXR5 420 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 DCDC2Q9UHG0 476 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TEKT2Q9UIF3 430 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ATG4BQ9Y4P1 393 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SCN2AQ99250 2005 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 G3V2L1 256 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TMPRSS11DO60235 418 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CTNSO60931 367 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CDH16O75309 829 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GLRA3O75311 464 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 VPS4BO75351 444 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PDYNP01213 254 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PROCP04070 461 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 KRT4P19013 534 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 IMPDH1P20839 514 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GNLYP22749 145 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TNFSF10P50591 281 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PRKAA2P54646 552 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 STX4Q12846 297 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 IFT88Q13099 833 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CUL3Q13618 768 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GGTA1PQ4G0N0 100 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 C18orf63Q68DL7 685 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 WDR93Q6P2C0 686 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ATCAYQ86WG3 371 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SLC5A8Q8N695 610 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CCNYL1Q8N7R7 359 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CDYL2Q8N8U2 506 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 HAS2Q92819 552 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZNF354BQ96LW1 612 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PARD6BQ9BYG5 372 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ELOVL6Q9H5J4 265 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CDCP1Q9H5V8 836 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 VPS4AQ9UN37 437 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SPACA6W5XKT8 324 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 A0A0A6YYD5 115 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 OR5H15A6NDH6 313 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GLOD5A6NK44 160 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 WASHC1A8K0Z3 465 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TCP11X1B4DZS4 312 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 COPEO14579 308 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 FGF17O60258 216 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PLIN3O60664 434 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NUDT17P0C025 328 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MYL2P10916 166 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TSFMP43897 325 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TAS2R50P59544 299 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 IFFO1Q0D2I5 559 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TUBA3CQ13748 450 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 RASA2Q15283 850 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 EMBQ6PCB8 327 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TUBA3EQ6PEY2 450 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZYG11AQ6WRX3 759 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GPR180Q86V85 440 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SLC22A9Q8IVM8 553 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 APCDD1LQ8NCL9 501 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GALNT11Q8NCW6 608 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 B3GNT7Q8NFL0 401 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 UCN3Q969E3 161 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NCLNQ969V3 563 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 L3HYPDHQ96EM0 354 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SERPINI1Q99574 410 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 RNF32Q9H0A6 362 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ADAP2Q9NPF8 381 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TRPS1Q9UHF7 1281 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SLC12A4Q9UP95 1085 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ASB4Q9Y574 426 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MYO18BQ8IUG5 2567 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NBASA2RRP1 2371 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TRAV17A0A0B4J275 112 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 A0A1W2PR48 441 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ARHGAP10A1A4S6 786 aa12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms