RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 C9orf64Q5T6V5 341 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 ALKAL1Q6UXT8 129 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 COMTD1Q86VU5 262 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEFF1Q8IYR6 380 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC44A3Q8N4M1 653 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 CNTD1Q8N815 330 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 GALNT11Q8NCW6 608 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 GSTCDQ8NEC7 633 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 OR4E2Q8NGC2 313 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 COQ8AQ8NI60 647 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 C1orf216Q8TAB5 229 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 LMO3Q8TAP4 145 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 RDH11Q8TC12 318 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 CPT1BQ92523 772 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 ARL11Q969Q4 196 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC41A3Q96GZ6 507 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 KCTD7Q96MP8 289 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 TSGA13Q96PP4 275 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 AGAP2Q99490 1192 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 PRRX2Q99811 253 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC30A2Q9BRI3 323 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 DUSP23Q9BVJ7 150 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 GON7Q9BXV9 100 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 TXLNGYQ9BZA5 131 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 BRINP2Q9C0B6 783 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 DCSTAMPQ9H295 470 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 SYT4Q9H2B2 425 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 IFT46Q9NQC8 304 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 HRASLS2Q9NWW9 162 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 NUDT4Q9NZJ9 180 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 MED16Q9Y2X0 877 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 F8W036 122 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 B3GALT2O43825 422 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 NRP2O60462 931 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 MITFO75030 526 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 BANF1O75531 89 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 SLITRK5O94991 958 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 F11P03951 625 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 C6P13671 934 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 NT5EP21589 574 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 NMBRP28336 390 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 CD38P28907 300 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC1A2P43004 574 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 FNTBP49356 437 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 CAPZA1P52907 286 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 CDH13P55290 713 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 BLOC1S1P78537 153 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 CHIT1Q13231 466 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 BCL2A1Q16548 175 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 ARHGAP40Q5TG30 622 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 LPCAT4Q643R3 524 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 MTFR2Q6P444 385 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 PARM1Q6UWI2 310 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 BEND4Q6ZU67 534 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 GAREM2Q75VX8 874 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 COX15Q7KZN9 410 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 CLNKQ7Z7G1 428 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 PIM3Q86V86 326 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 SCML4Q8N228 414 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 RASGEF1CQ8N431 466 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 CHST4Q8NCG5 386 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 BEST4Q8NFU0 473 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 OR7G1Q8NGA0 311 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 STK35Q8TDR2 534 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 NEK7Q8TDX7 302 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 SNX33Q8WV41 574 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 SGCDQ92629 289 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 CORO2AQ92828 525 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 ART4Q93070 314 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 MR1Q95460 341 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 GLYATL1Q969I3 302 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 NXPE2Q96DL1 559 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM68Q96MH6 324 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF607Q96SK3 696 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 CIB1Q99828 191 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 NECTIN3Q9NQS3 549 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 SEMA3GQ9NS98 782 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 ALKBH4Q9NXW9 302 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 FBXW2Q9UKT8 454 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 PHIPQ8WWQ0 1821 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 F5P12259 2224 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 A0A0J9YVX5 310 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF487B1APH4 448 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 E9PI62 339 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 SDC3O75056 442 aa4.25□□□□□ -1.73
ANKRD28-202ENST00000412318 CLDN9O95484 217 aa4.25□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.4 ms