RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 A4GALTQ9NPC4 353 aa22.8■■□□□ 1.24
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TRIM54-201ENST00000296098 MOSPD1Q9UJG1 213 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 PSME2Q9UL46 239 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa22.8■■□□□ 1.24
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TRIM54-201ENST00000296098 PRAMEF10O60809 474 aa22.79■■□□□ 1.24
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TRIM54-201ENST00000296098 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa22.79■■□□□ 1.24
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TRIM54-201ENST00000296098 POFUT2Q9Y2G5 429 aa22.79■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 GPSM3Q9Y4H4 160 aa22.79■■□□□ 1.24
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TRIM54-201ENST00000296098 ENPP4Q9Y6X5 453 aa22.78■■□□□ 1.24
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TRIM54-201ENST00000296098 BCHEP06276 602 aa22.77■■□□□ 1.24
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TRIM54-201ENST00000296098 SVOPQ8N4V2 548 aa22.77■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 OR52E1Q8NGJ3 308 aa22.77■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 APH1BQ8WW43 257 aa22.77■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
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TRIM54-201ENST00000296098 BNIP3Q12983 259 aa22.77■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.77■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa22.77■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 SLC38A5Q8WUX1 472 aa22.77■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
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