RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260270.2

FDX1-201, Transcript of ferredoxin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FDX1, Length 3,206 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDX1-201ENST00000260270 TDP1Q9NUW8 608 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 COQ3Q9NZJ6 369 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 KCNE2Q9Y6J6 123 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 MEN1O00255 615 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 TFECO14948 347 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 DSCR3O14972 297 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 UQCRC2P22695 453 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 RRM2P31350 389 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 LIPAP38571 399 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 MADCAM1Q13477 382 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 CEP78Q5JTW2 689 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 KIAA1211LQ6NV74 962 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 COL21A1Q96P44 957 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 TMEM246Q9BRR3 403 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 DSN1Q9H410 356 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 RIBC2Q9H4K1 309 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 TAS2R9Q9NYW1 312 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 SPASTQ9UBP0 616 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 ENPP4Q9Y6X5 453 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 A0A075B6Q4 140 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 SAGE2PA6NJ88 616 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 hCG_2039718K7EN88 272 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 DYRK3O43781 588 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 ICMTO60725 284 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 TIMP1P01033 207 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 TP53P04637 393 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 CASP3P42574 277 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 COX20Q5RI15 118 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 ADNP2Q6IQ32 1131 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 SLC38A6Q8IZM9 456 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 AUTS2Q8WXX7 1259 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 TMEM159Q96B96 161 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 ATG10Q9H0Y0 220 aa15.6■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 SEC14L5O43304 696 aa15.59■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 LRATO95237 230 aa15.59■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 IFI30P13284 250 aa15.59■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 RPS13P62277 151 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 CADM2Q8N3J6 435 aa15.59■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP15.59■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 C5orf67F2Z3F1 127 aa15.59■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 HSD17B2P37059 387 aa15.59■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 TLE2Q04725 743 aa15.59■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 NAE1Q13564 534 aa15.59■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 CEBPEQ15744 281 aa15.59■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 ZNF621Q6ZSS3 439 aa15.59■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 SLC5A11Q8WWX8 675 aa15.59■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 TAAR2Q9P1P5 351 aa15.59■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa15.59■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 AP3D1O14617 1153 aa15.58■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 PRKCAP17252 672 aa15.58■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 IFNA8P32881 189 aa15.58■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 BDKRB1P46663 353 aa15.58■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 DAB2P98082 770 aa15.58■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 SCARB2Q14108 478 aa15.58■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 ZNF284Q2VY69 593 aa15.58■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa15.58■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa15.58■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 LYPD8Q6UX82 237 aa15.58■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 ZNF852Q6ZMS4 543 aa15.58■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 ZNF540Q8NDQ6 660 aa15.58■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 PROX1Q92786 737 aa15.58■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa15.58■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 C14orf119Q9NWQ9 140 aa15.58■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 ZNF221Q9UK13 617 aa15.58■□□□□ 0.09
FDX1-201ENST00000260270 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa15.58■□□□□ 0.08
FDX1-201ENST00000260270 GPR89AB7ZAQ6 455 aa15.58■□□□□ 0.08
FDX1-201ENST00000260270 UPK1BO75841 260 aa15.58■□□□□ 0.08
FDX1-201ENST00000260270 ADAP00813 363 aa15.58■□□□□ 0.08
FDX1-201ENST00000260270 GPR89BP0CG08 455 aa15.58■□□□□ 0.08
FDX1-201ENST00000260270 ADORA3P0DMS8 318 aa15.58■□□□□ 0.08
FDX1-201ENST00000260270 REEP5Q00765 189 aa15.58■□□□□ 0.08
FDX1-201ENST00000260270 RHAGQ02094 409 aa15.58■□□□□ 0.08
FDX1-201ENST00000260270 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
FDX1-201ENST00000260270 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
FDX1-201ENST00000260270 TRIM40Q6P9F5 258 aa15.58■□□□□ 0.08
FDX1-201ENST00000260270 OR10G2Q8NGC3 310 aa15.58■□□□□ 0.08
FDX1-201ENST00000260270 OR4A15Q8NGL6 344 aa15.58■□□□□ 0.08
FDX1-201ENST00000260270 FEVQ99581 238 aa15.58■□□□□ 0.08
FDX1-201ENST00000260270 LHX9Q9NQ69 397 aa15.58■□□□□ 0.08
FDX1-201ENST00000260270 PLK4O00444 970 aa15.58■□□□□ 0.08
FDX1-201ENST00000260270 CRYZL1O95825 349 aa15.58■□□□□ 0.08
FDX1-201ENST00000260270 IFNA14P01570 189 aa15.58■□□□□ 0.08
FDX1-201ENST00000260270 OLR1P78380 273 aa15.58■□□□□ 0.08
FDX1-201ENST00000260270 ZNF45Q02386 682 aa15.58■□□□□ 0.08
FDX1-201ENST00000260270 ARSIQ5FYB1 569 aa15.58■□□□□ 0.08
FDX1-201ENST00000260270 MEDAGQ5VYS4 303 aa15.58■□□□□ 0.08
FDX1-201ENST00000260270 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa15.58■□□□□ 0.08
FDX1-201ENST00000260270 SLC9B2Q86UD5 537 aa15.58■□□□□ 0.08
FDX1-201ENST00000260270 PDZD3Q86UT5 571 aa15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms