RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 TAS2R50P59544 299 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 P2RY14Q15391 338 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 TUBA3EQ6PEY2 450 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 HUS1BQ8NHY5 278 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 POF1BQ8WVV4 589 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 OPALINQ96PE5 141 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 BCL7BQ9BQE9 202 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 TSSK6Q9BXA6 273 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 SLC29A3Q9BZD2 475 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 FNIP2Q9P278 1114 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 ATP6V1HQ9UI12 483 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 CMAHPQ9Y471 501 aa16.02■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 ISM1B1AKI9 464 aa16.02■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 H3BNC9 293 aa16.02■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 UGT2B10P36537 528 aa16.02■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 KIR2DL3P43628 341 aa16.02■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 CRISP1P54107 249 aa16.02■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 GPR17Q13304 367 aa16.02■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 GPR50Q13585 617 aa16.02■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 WDR45BQ5MNZ6 344 aa16.02■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 PLAG1Q6DJT9 500 aa16.02■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 FRMPD2BQ6IN97 320 aa16.02■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 IL20RBQ6UXL0 311 aa16.02■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 SLC22A4Q9H015 551 aa16.02■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa16.02■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 PLK4O00444 970 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 CSO75390 466 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 TOXO94900 526 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 WSCD2Q2TBF2 565 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 Q6ZVL8 140 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 KRT73Q86Y46 540 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 OR8H3Q8N146 312 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 XAGE5Q8WWM1 108 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 WASHC1A8K0Z3 465 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 OR2B3O76000 313 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 SLC16A8O95907 504 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 SYPP08247 313 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 HOXC8P31273 242 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 NSG1P42857 185 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 GSTM5P46439 218 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 C1DQ13901 141 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 WASH2PQ6VEQ5 465 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 PDZD3Q86UT5 571 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 WDR48Q8TAF3 677 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 MAP6Q96JE9 813 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 PLAGL1Q9UM63 463 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 TEX46H3BTG2 121 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 SYN3O14994 580 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 IFNW1P05000 195 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 GALTP07902 379 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 CNTN1Q12860 1018 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 TTTY10Q9BZA0 68 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 AP3M1Q9Y2T2 418 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 SDK1Q7Z5N4 2213 aa16■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 A0A0X1KG70 313 aa16■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 HPGDSO60760 199 aa16■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 PEPDP12955 493 aa16■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 SLC16A1P53985 500 aa16■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 TLE2Q04725 743 aa16■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 DSC1Q08554 894 aa16■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 MPPE1Q53F39 396 aa16■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 DDI2Q5TDH0 399 aa16■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 SLC9A6Q92581 669 aa16■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 PPCDCQ96CD2 204 aa16■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 ARSGQ96EG1 525 aa16■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 ERVW-1Q9UQF0 538 aa16■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 PRELID1Q9Y255 219 aa16■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 H7C4K7 107 aa16■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 FRS3O43559 492 aa16■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 SCN2BO60939 215 aa16■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 HBQ1P09105 142 aa16■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 CSF3P09919 207 aa16■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 B4GALNT1Q00973 533 aa16■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 SNAPC1Q16533 368 aa16■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 CRTC1Q6UUV9 634 aa16■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 PIPSLA2A3N6 862 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 B4DXG7 233 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 ALX3O95076 343 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 PDHA2P29803 388 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 XKP51811 444 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 CTBP2P56545 445 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 FBXO43Q4G163 708 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 AGTRAPQ6RW13 159 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 Q8N402 240 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 SNX18Q96RF0 628 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 KCNK12Q9HB15 430 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 ANKRD36A6QL64 1941 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF840PA6NDX5 716 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms