RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000093061.6

Trim11-201, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trim11, Length 2,251 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim11-201ENSMUST00000093061 Tex13bQ99MW5 186 aa14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ptges3lQ9D9A7 131 aa14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Olfr630Q9EQQ7 319 aa14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Igkv6-29A0A0G2JEI6 115 aa14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rpl7a-ps3A0A140T8L1 270 aa14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Olfr1006A2ALD2 312 aa14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Vmn2r35E9Q7U8 861 aa14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Pld3O35405 488 aa14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Sap18O55128 153 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rpl3P27659 403 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rab23P35288 237 aa14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ube2e3P52483 207 aa14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Vbp1P61759 196 aa14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Kcna7Q17ST2 489 aa14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 VclQ64727 1066 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Olig3Q6PFG8 273 aa14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 GalpQ810H5 117 aa14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Zbtb42Q811H0 420 aa14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Aifm2Q8BUE4 373 aa14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Bbs4Q8C1Z7 520 aa14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Utp4Q8R2N2 686 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ttc4Q8R3H9 386 aa14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Oard1Q8R5F3 152 aa14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Vps4aQ8VEJ9 437 aa14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Olfr353Q8VGK0 311 aa14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rpp25Q91WE3 199 aa14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Kiaa2013Q91X21 634 aa14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ska1Q9CPV1 254 aa14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Asf1aQ9CQE6 204 aa14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ccdc77Q9CZH8 489 aa14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 UxtQ9WTZ0 157 aa14.91□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rhox2bA2A447 191 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rhox2cA2AWL9 191 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gabrr3B2RXA8 464 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Matn3O35701 481 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Psmb10O35955 273 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Syn1O88935 706 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 PahP16331 453 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Lsm3P62311 102 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Sfmbt2Q5DTW2 938 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Slc17a4Q5NCM1 492 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Olfr1364Q5SZS9 314 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Olfr1418Q7TQS3 318 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Acat3Q80X81 397 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Tbl3Q8C4J7 801 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Q8K039 155 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Man2c1Q91W89 1039 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Prmt3Q922H1 532 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Trim16Q99PP9 556 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Yipf5Q9EQQ2 257 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Clca3a2Q9EQR4 902 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Hapln1Q9QUP5 356 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Zfp362B1ASA5 418 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gm8237E9Q257 205 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Tsc22d1P62500 1077 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Kcnj8P97794 424 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 BcheQ03311 603 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Pros1Q08761 675 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Dusp5Q1HL35 384 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Usp30Q3UN04 517 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Cpxcr1Q3V0P1 322 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Nr1d2Q60674 576 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gas6Q61592 674 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Slc6a15Q8BG16 729 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Npsr1Q8BZP8 371 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Slc38a4Q8R1S9 547 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 NrmQ8VC65 262 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Cbr4Q91VT4 236 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Riok2Q9CQS5 547 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 2010109A12RikQ9D875 119 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 PgdQ9DCD0 483 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rad9aQ9Z0F6 389 aa14.9□□□□□ -0.02
Trim11-201ENSMUST00000093061 Zfp808B8JJZ4 753 aa14.89□□□□□ -0.03
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gm6811E9Q3Y8 510 aa14.89□□□□□ -0.03
Trim11-201ENSMUST00000093061 Olfr376E9Q4M1 320 aa14.89□□□□□ -0.03
Trim11-201ENSMUST00000093061 Serpinb9cI7HJI5 387 aa14.89□□□□□ -0.03
Trim11-201ENSMUST00000093061 1700122O11RikJ3QPW6 241 aa14.89□□□□□ -0.03
Trim11-201ENSMUST00000093061 Dnajb3O35723 242 aa14.89□□□□□ -0.03
Trim11-201ENSMUST00000093061 EnpepP16406 945 aa14.89□□□□□ -0.03
Trim11-201ENSMUST00000093061 Gja4P28235 333 aa14.89□□□□□ -0.03
Trim11-201ENSMUST00000093061 BgnP28653 369 aa14.89□□□□□ -0.03
Trim11-201ENSMUST00000093061 Il12rb2P97378 874 aa14.89□□□□□ -0.03
Trim11-201ENSMUST00000093061 Kcnk2P97438 426 aa14.89□□□□□ -0.03
Trim11-201ENSMUST00000093061 Foxs1Q61574 329 aa14.89□□□□□ -0.03
Trim11-201ENSMUST00000093061 Olfr1344Q7TQV3 321 aa14.89□□□□□ -0.03
Trim11-201ENSMUST00000093061 Olfr1045Q7TR80 315 aa14.89□□□□□ -0.03
Trim11-201ENSMUST00000093061 PeloQ80X73 385 aa14.89□□□□□ -0.03
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ift80Q8K057 777 aa14.89□□□□□ -0.03
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ing3Q8VEK6 421 aa14.89□□□□□ -0.03
Trim11-201ENSMUST00000093061 Olfr1093Q8VF14 322 aa14.89□□□□□ -0.03
Trim11-201ENSMUST00000093061 Olfr447Q8VGP6 310 aa14.89□□□□□ -0.03
Trim11-201ENSMUST00000093061 Slc8b1Q925Q3 585 aa14.89□□□□□ -0.03
Trim11-201ENSMUST00000093061 Rab28Q99KL7 221 aa14.89□□□□□ -0.03
Trim11-201ENSMUST00000093061 Fam32aQ9CR80 112 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Trim11-201ENSMUST00000093061 Ranbp3Q9CT10 491 aa14.89□□□□□ -0.03
Trim11-201ENSMUST00000093061 Upk3bl1Q9D701 249 aa14.89□□□□□ -0.03
Trim11-201ENSMUST00000093061 Panx1Q9JIP4 426 aa14.89□□□□□ -0.03
Trim11-201ENSMUST00000093061 ItgaxQ9QXH4 1169 aa14.89□□□□□ -0.03
Trim11-201ENSMUST00000093061 Thbs4Q9Z1T2 963 aa14.89□□□□□ -0.03
Trim11-201ENSMUST00000093061 Fkbp9Q9Z247 570 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33 ms