RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042824.12

Herc1-201, Transcript of HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Herc1, Length 15,153 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1-201ENSMUST00000042824 Lrrc3P59034 257 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tbpl1P62340 186 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Aup1P70295 410 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 WasP70315 520 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cep76Q0VEJ0 659 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ces2bQ6PDB7 556 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Hfe2Q7TQ32 420 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Coro2bQ8BH44 480 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cdkl1Q8CEQ0 352 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Defb36Q8K3U4 67 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 FlcnQ8QZS3 579 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gpn2Q8VEJ1 310 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cwh43Q91YL7 699 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tcam1Q99NB3 548 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Pno1Q9CPS7 248 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Bcl7aQ9CXE2 210 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ccdc86Q9JJ89 426 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tmem240B2RWJ3 173 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 FgaE9PV24 789 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm20441G3UYJ7 252 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ston2Q8BZ60 895 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Csnka2ipQ8CH19 720 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Irak3Q8K4B2 609 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Slco1a5Q91YY5 670 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Pbld1Q9DCG6 288 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm5798F7BTS7 198 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Opn1mwO35599 359 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cdh12Q5RJH3 794 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Clec4b1Q7TS58 209 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Med17Q8VCD5 649 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gpr37l1Q99JG2 481 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rgs1Q9JL25 209 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Slc7a5Q9Z127 512 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Kcna10B2RQA1 511 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Zfp563B8JJZ9 448 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Xkr6E9Q6C8 638 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Vmn2r8L7N472 848 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Smpd1Q04519 627 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Dusp2Q05922 318 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Acsm3Q3UNX5 580 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ppp3r1Q63810 170 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gen1Q8BMI4 908 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Q8CF31 99 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Krtcap3Q8K177 240 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Slc9a8Q8R4D1 576 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Adck1Q9D0L4 525 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Psmg2Q9EST4 264 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Nectin1Q9JKF6 515 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Bace2Q9JL18 514 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Upk1bQ9Z2C6 260 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Fam155bA2BDP1 471 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Nsg2P47759 171 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gpat2Q14DK4 801 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 4930503B20RikQ80ZP0 234 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Slc36a2Q8BHK3 478 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Znf784Q8BI69 297 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Peli2Q8BST6 419 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Myoz3Q8R4E4 245 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ttc36Q8VBW8 186 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Zswim1Q9CWV7 455 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gje1Q9CX92 205 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 PigkQ9CXY9 395 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm5799E9Q2M1 201 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 RoraP51448 523 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Vipr1P97751 459 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Dlk1Q09163 385 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Hectd3Q3U487 861 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Zfp658Q5PPQ4 887 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cd34Q64314 382 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cyp2d40Q6P8N9 338 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cyp2r1Q6VVW9 501 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Lats1Q8BYR2 1129 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr692Q8VF03 329 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Spata19Q9DAQ9 154 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cd302Q9DCG2 228 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 PatjQ63ZW7 1834 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ighv11-1A0A075B5R6 117 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Vmn2r50E9PW61 861 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 JunbP09450 344 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Kctd21Q3URF8 260 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm813Q3UWK9 176 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rbl1Q64701 1063 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Pou6f2Q8BJI4 691 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Mettl6Q8BVH9 282 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr459Q924H8 314 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Slamf1Q9QUM4 343 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 NrapQ80XB4 1728 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr1056A2AVY0 313 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Acvr2aP27038 513 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Kcnj12P52187 427 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm14226Q3TZL0 686 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Eci3Q78JN3 317 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr353Q8VGK0 311 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Dcp1aQ91YD3 602 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Clcc1Q99LI2 539 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Isca2Q9DCB8 154 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tnfrsf21Q9EPU5 655 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Clec3aQ9EPW4 196 aa5.63□□□□□ -1.51
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gsk3bQ9WV60 420 aa5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.8 ms