RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
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ATG4D-210ENST00000588972 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa7.41□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 HAO1Q9UJM8 370 aa7.41□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa7.41□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 SESN1Q9Y6P5 492 aa7.41□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 NOTCH2Q04721 2471 aa7.41□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
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ATG4D-210ENST00000588972 K7ESM1 405 aa7.4□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 RRHO14718 337 aa7.4□□□□□ -1.22
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ATG4D-210ENST00000588972 IL1AP01583 271 aa7.4□□□□□ -1.22
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ATG4D-210ENST00000588972 SLC25A45Q8N413 288 aa7.4□□□□□ -1.22
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ATG4D-210ENST00000588972 ZNF567Q8N184 647 aa7.39□□□□□ -1.23
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ATG4D-210ENST00000588972 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 MAPK15Q8TD08 544 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 CXorf40AQ8TE69 158 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 HTR3CQ8WXA8 447 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 RAB7BQ96AH8 199 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 SLC17A9Q9BYT1 436 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 TRIM4Q9C037 500 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 ABCG4Q9H172 646 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG4D-210ENST00000588972 SLC6A13Q9NSD5 602 aa7.39□□□□□ -1.23
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