RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588516.5

NEDD4L-223, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene NEDD4L, Length 1,304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-223	ENST00000588516	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	EXD2	Q9NVH0	621 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516		A0A1W2PRB8	838 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	PIPSL	A2A3N6	862 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	C5orf58	C9J3I9	102 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	NPC1	O15118	1278 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	MAGEB3	O15480	346 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	AIRE	O43918	545 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	IFNW1	P05000	195 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ARAF	P10398	606 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	NPPB	P16860	134 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ITGB7	P26010	798 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	S100A5	P33763	92 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	MAP2K4	P45985	399 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	PREP	P48147	710 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	DGKG	P49619	791 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	PPP5C	P53041	499 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	TBPL1	P62380	186 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	PIGF	Q07326	219 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	CNTN1	Q12860	1018 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ATP1A4	Q13733	1029 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	OXA1L	Q15070	435 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	TEAD2	Q15562	447 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	FLCN	Q8NFG4	579 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	GPR156	Q8NFN8	814 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	MCFD2	Q8NI22	146 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF480	Q8WV37	535 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	NEIL2	Q969S2	332 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	DACH2	Q96NX9	599 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	FEV	Q99581	238 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	NT5DC2	Q9H857	520 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	DYRK4	Q9NR20	520 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	CLN6	Q9NWW5	311 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	RNF6	Q9Y252	685 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	TTC34	A8MYJ7	566 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516		J3QRK9	145 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	GJA1	P17302	382 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	WEE1	P30291	646 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	SOX6	P35712	828 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	GPR1	P46091	355 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	PSMD7	P51665	324 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	CTSC	P53634	463 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	DSTN	P60981	165 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF45	Q02386	682 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	TIGD6	Q17RP2	521 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF404	Q494X3	552 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	REEP3	Q6NUK4	255 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	AHSA2	Q719I0	299 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	LGI4	Q8N135	537 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	OR2L2	Q8NH16	312 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	SGCD	Q92629	289 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	RAB7B	Q96AH8	199 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	NUS1	Q96E22	293 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	TCF25	Q9BQ70	676 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NEDD4L-223	ENST00000588516	SP140L	Q9H930	580 aa		13.42	□□□□□ -0.26

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