RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 MS4A6EQ96DS6 147 aa6.7□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.7□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 F2RL3Q96RI0 385 aa6.7□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 RBBP8Q99708 897 aa6.7□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 DERL2Q9GZP9 239 aa6.7□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 ALG9Q9H6U8 611 aa6.7□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 POPDC3Q9HBV1 291 aa6.7□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa6.7□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 GRHL1Q9NZI5 618 aa6.7□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 RNF112Q9ULX5 631 aa6.7□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 ASB1Q9Y576 335 aa6.7□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 ASPDHA6ND91 283 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRIT2A6NDA9 550 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 C19orf84I3L1E1 186 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 SAP18O00422 153 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 ASNA1O43681 348 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 HS6ST1O60243 411 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 ITGA10O75578 1167 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 STK16O75716 305 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 MLYCDO95822 493 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 SMIM10L1P0DMW3 83 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCNAP12004 261 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 COX6B1P14854 86 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 STMN1P16949 149 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 GP5P40197 560 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 MSH2P43246 934 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 HLCSP50747 726 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 CLCN2P51788 898 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 PLTPP55058 493 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPX6P59796 221 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC7A5Q01650 507 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 POU4F1Q01851 419 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 ART3Q13508 389 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 BMPR2Q13873 1038 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRADDQ15628 312 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 MTFR2Q6P444 385 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRIM40Q6P9F5 258 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 RPTNQ6XPR3 784 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAPH1Q70E73 1250 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 MDGA2Q7Z553 956 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 FGD2Q7Z6J4 655 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 TICAM1Q8IUC6 712 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPPL2CQ8IUH8 684 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC34A3Q8N130 599 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 LGI4Q8N135 537 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 GHDCQ8N2G8 530 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 RNF175Q8N4F7 328 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM156Q8N614 296 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPM1NQ8N819 430 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 BBOF1Q8ND07 529 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR2L5Q8NG80 312 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 DOK4Q8TEW6 326 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 AGAP11Q8TF27 550 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 VMP1Q96GC9 406 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 SMIM10Q96HG1 83 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 QRFPRQ96P65 431 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPR22Q99680 433 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 CPNE1Q99829 537 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 SH3GL2Q99962 352 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC77Q9BR77 488 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 ERP44Q9BS26 406 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR8D2Q9GZM6 311 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 KCMF1Q9P0J7 381 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 WHRNQ9P202 907 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 ERVK-11Q9UQG0 969 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 MMACHCQ9Y4U1 282 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa6.69□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A088AWK7 358 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A0G2JMM0 328 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A1W2PPB8 328 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A1W2PRS3 328 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 ESYT3A0FGR9 886 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM187AA6NFU0 413 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM159BA6NKW6 160 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 ENO4A6NNW6 628 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM166BA8MTA8 275 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 KIR3DP1A8MWS1 328 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 UBXN8O00124 270 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 WWP2O00308 870 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 CLDN4O14493 209 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 PEX1O43933 1283 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 LDB3O75112 727 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 CLEC3AO75596 197 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR2J2O76002 312 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 PDE9AO76083 593 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.4 ms