RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562136.1

HERC2-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 2

Gene HERC2, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-202ENST00000562136 XKR6Q5GH73 641 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC2-202ENST00000562136 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC2-202ENST00000562136 SPNS3Q6ZMD2 512 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC2-202ENST00000562136 RGS9BPQ6ZS82 235 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC2-202ENST00000562136 KRT78Q8N1N4 520 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC2-202ENST00000562136 TCAIMQ8N3R3 496 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC2-202ENST00000562136 TMEM156Q8N614 296 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC2-202ENST00000562136 MORN4Q8NDC4 146 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC2-202ENST00000562136 PSD4Q8NDX1 1056 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC2-202ENST00000562136 FBXO36Q8NEA4 188 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC2-202ENST00000562136 OR8K3Q8NH51 312 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC2-202ENST00000562136 LILRB4Q8NHJ6 448 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC2-202ENST00000562136 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
HERC2-202ENST00000562136 VPS39Q96JC1 886 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC2-202ENST00000562136 FAR2Q96K12 515 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC2-202ENST00000562136 CAPZA3Q96KX2 299 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC2-202ENST00000562136 SERINC2Q96SA4 455 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC2-202ENST00000562136 LYRM4Q9HD34 91 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC2-202ENST00000562136 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC2-202ENST00000562136 SMYD2Q9NRG4 433 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC2-202ENST00000562136 MYOTQ9UBF9 498 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC2-202ENST00000562136 PPT2Q9UMR5 302 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC2-202ENST00000562136 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
HERC2-202ENST00000562136 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
HERC2-202ENST00000562136 FREM3P0C091 2139 aa11.65□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 NCKAP5O14513 1909 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 B3GALT2O43825 422 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 IGHG3P01860 377 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 C1QAP02745 245 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 EPORP19235 508 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 CD22P20273 847 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 SSR4P51571 173 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 MTTPP55157 894 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 RIPPLY3P57055 190 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 HYAL4Q2M3T9 481 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 TMEM211Q6ICI0 200 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 C3P1Q6ZMU1 363 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 UBE3DQ7Z6J8 389 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 CD163Q86VB7 1156 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 ANKMY2Q8IV38 441 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 PDPRQ8NCN5 879 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 OR52N2Q8NGI0 321 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 ASB5Q8WWX0 329 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 KIAA1191Q96A73 305 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 SDCCAG3Q96C92 435 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 UBXN10Q96LJ8 280 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 RASL10BQ96S79 203 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 EGFL8Q99944 293 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 KCNF1Q9H3M0 494 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 COQ3Q9NZJ6 369 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 FBXW2Q9UKT8 454 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 NINQ8N4C6 2090 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 A0A0G2JN53 185 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 A0A1B0GVC2 190 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 PINLYPA6NC86 204 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 ANKDD1BA6NHY2 528 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 CCDC188H7C350 402 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 OR2J2O76002 312 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 TOXO94900 526 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 CD1DP15813 335 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 CHRNB4P30926 498 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 RFC3P40938 356 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 RPL21P46778 160 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 HK2P52789 917 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 SLC13A2Q13183 592 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 DOC2AQ14183 400 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 RCN2Q14257 317 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 SULT1C3Q6IMI6 304 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 ADNP2Q6IQ32 1131 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 TRIM40Q6P9F5 258 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 HSDL2Q6YN16 418 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 GOLM1Q8NBJ4 401 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 C7orf57Q8NEG2 295 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 OR2M7Q8NG81 312 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 OR14A16Q8NHC5 309 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 CSF3RQ99062 836 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 GPR22Q99680 433 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 CCDC77Q9BR77 488 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 EFCAB11Q9BUY7 163 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 SH2D2AQ9NP31 389 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 DNAJC11Q9NVH1 559 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 RNF6Q9Y252 685 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HERC2-202ENST00000562136 AKAP6Q13023 2319 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms