RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 NYAP1Q6ZVC0 841 aa7.73□□□□□ -1.17
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PTPRB-209ENST00000550857 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 GMPPBQ9Y5P6 360 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 COL24A1Q17RW2 1714 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa7.72□□□□□ -1.17
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