RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531432.1

PPP6R3-223, Transcript of protein phosphatase 6 regulatory subunit 3, human

TSL 3

Gene PPP6R3, Length 589 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP6R3-223	ENST00000531432	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	SPATA17	Q96L03	361 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	KLK11	Q9UBX7	282 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	ILVBL	A1L0T0	632 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	ZNF732	B4DXR9	585 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	LMO7DN	F2Z398	122 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	CTNNA2	P26232	953 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	OXTR	P30559	389 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	SRD5A2	P31213	254 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	ETV5	P41161	510 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	NPBWR1	P48145	328 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	COX10	Q12887	443 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	BFSP1	Q12934	665 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	PPA1	Q15181	289 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	CASC4	Q6P4E1	433 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432		Q6ZVQ6	151 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	ANKRD46	Q86W74	232 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	SUN2	Q9UH99	717 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	KBTBD13	C9JR72	458 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	CTDSPL	O15194	276 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	IGHV3-13	P01766	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	SOAT1	P35610	550 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	CAPG	P40121	348 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	SLC8A3	P57103	927 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	ERVK-16	P61578	105 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	ZNF146	Q15072	292 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	C16orf87	Q6PH81	154 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	AMER3	Q8N944	861 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	RASL10A	Q92737	203 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	ATG101	Q9BSB4	218 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	GNB4	Q9HAV0	340 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	MRGBP	Q9NV56	204 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	PREX2	Q70Z35	1606 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
PPP6R3-223	ENST00000531432	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	HPR	P00739	348 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	CETN1	Q12798	172 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	ABR	Q12979	859 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	SCARB2	Q14108	478 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	UPP1	Q16831	310 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	OR8H3	Q8N146	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	SMYD1	Q8NB12	490 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		4.96	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms