RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	GTF3C1	Q12789	2109 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	AKAP6	Q13023	2319 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM166B	A8MTA8	275 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511		A8MUA0	341 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	PROM1	O43490	865 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB14	O43829	449 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	VAPB	O95292	243 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ESR1	P03372	595 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	TUBB4A	P04350	444 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	SERPIND1	P05546	499 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ACVR2A	P27037	513 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	UQCRC1	P31930	480 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAM8	P78325	824 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	CRADD	P78560	199 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	KEAP1	Q14145	624 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNJ11	Q14654	390 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	HERC3	Q15034	1050 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	PDSS2	Q86YH6	399 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC89	Q8N998	374 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC46	Q96FV0	321 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	BIRC8	Q96P09	236 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	SMC6	Q96SB8	1091 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	DLL4	Q9NR61	685 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	RASSF1	Q9NS23	344 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	LANCL2	Q9NS86	450 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SKAP2-209	ENST00000497511	SCN2A	Q99250	2005 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	BCKDK	O14874	412 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC16A5	O15375	505 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFS4	O43181	175 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	ITGA10	O75578	1167 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	NMBR	P28336	390 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	CLCN2	P51788	898 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	TBPL1	P62380	186 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	OLR1	P78380	273 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	DEFB134	Q4QY38	66 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	CES3	Q6UWW8	571 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	PEX26	Q7Z412	305 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	MDGA2	Q7Z553	956 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	C17orf64	Q86WR6	236 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	CDC20B	Q86Y33	519 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	LPGAT1	Q92604	370 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	C18orf12	Q96KH6	178 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC138	Q96M89	665 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	SMR3A	Q99954	134 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC77	Q9BR77	488 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	RHBG	Q9H310	441 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	EXO5	Q9H790	373 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	BFAR	Q9NZS9	450 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	AMFR	Q9UKV5	643 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511		A8MVJ9	347 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		10.07	□□□□□ -0.8

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