RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460289.5

PTPN4-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 4

Gene PTPN4, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-208ENST00000460289 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 FETUBQ9UGM5 382 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 CYR61O00622 381 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 F10P00742 488 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 ARFIP1P53367 373 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 SLC29A2Q14542 456 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 TERF2Q15554 542 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 FCRLBQ6BAA4 426 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 CRLF3Q8IUI8 442 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 ACOT4Q8N9L9 421 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 L3MBTL4Q8NA19 623 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 FAM47BQ8NA70 645 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 FAR1Q8WVX9 515 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 RGMAQ96B86 450 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 CCDC77Q9BR77 488 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 TXLNGYQ9BZA5 131 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 OR51B5Q9H339 312 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 L2HGDHQ9H9P8 463 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 KCMF1Q9P0J7 381 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 BLACEA4D250 179 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 ANKUB1A6NFN9 424 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 A8MUA0 341 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 CTNSO60931 367 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 SCELO95171 688 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 CLDN9O95484 217 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 GCAP28676 217 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 SSR2P43308 183 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 RAP1GDS1P52306 607 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 OR4C11Q6IEV9 310 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 LCA5Q86VQ0 697 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 BEST3Q8N1M1 668 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 BCORP1Q8N888 145 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 C7orf57Q8NEG2 295 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 PSD3Q9NYI0 1048 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPN4-208ENST00000460289 RTCAO00442 366 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 PRAMEF2O60811 474 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 SH3BGRLO75368 114 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF793Q6ZN11 406 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 TMEM52Q8NDY8 209 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 B3GNT7Q8NFL0 401 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 PRR7Q8TB68 274 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 NPAS2Q99743 824 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 NTMT1Q9BV86 223 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 CDCP1Q9H5V8 836 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 DMRT3Q9NQL9 472 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 MS4A12Q9NXJ0 267 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 PCTPQ9UKL6 214 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 RNF11Q9Y3C5 154 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 ESPL1Q14674 2120 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 SAP18O00422 153 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 MYO1DO94832 1006 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 AGFG2O95081 481 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 EDN3P14138 238 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 CCNG1P51959 295 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 STX4Q12846 297 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 TUBA3CQ13748 450 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 TUBA3EQ6PEY2 450 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 KIF2BQ8N4N8 673 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 HORMAD2Q8N7B1 307 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 LRRN4CLQ8ND94 238 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 CSF3RQ99062 836 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 DEFB126Q9BYW3 111 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 OLAHQ9NV23 265 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 CLDN16Q9Y5I7 305 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
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PTPN4-208ENST00000460289 TAC1P20366 129 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 CPN2P22792 545 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 CD96P40200 585 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 CLCN2P51788 898 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 RPS13P62277 151 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 SLAMF1Q13291 335 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 CUL3Q13618 768 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 SERTAD2Q14140 314 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
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