RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 CLDN4O14493 209 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 PRAMEF2O60811 474 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 SCELO95171 688 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 RBP1P09455 135 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 GCAP28676 217 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 PPP2R1BP30154 601 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 SLC13A2Q13183 592 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 TUBA3CQ13748 450 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 LIPJQ5W064 366 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 TUBA3EQ6PEY2 450 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 CHSY3Q70JA7 882 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 LGI4Q8N135 537 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 CMTM7Q96FZ5 175 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 OR51B5Q9H339 312 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 IPPKQ9H8X2 491 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 LYRM4Q9HD34 91 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 ADGRE2Q9UHX3 823 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXB3-202ENST00000460160 RIPK2O43353 540 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 UGDHO60701 494 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 FAM153BP0C7A2 387 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 COL6A2P12110 1019 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 PIK3CBP42338 1070 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 TERF2Q15554 542 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 FAM153CQ494X1 144 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 DEPDC1Q5TB30 811 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 CLNKQ7Z7G1 428 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 ACOT4Q8N9L9 421 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 APCDD1LQ8NCL9 501 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 SUN3Q8TAQ9 357 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 PRM3Q9NNZ6 103 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 DMRT3Q9NQL9 472 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 OLAHQ9NV23 265 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 ABI3Q9P2A4 366 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 UNC79Q9P2D8 2635 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 BLACEA4D250 179 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 GABRR3A8MPY1 467 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 SAP18O00422 153 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 MYO1DO94832 1006 aa22.13■■□□□ 1.13
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HOXB3-202ENST00000460160 EDN3P14138 238 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 CD96P40200 585 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 PIK3CGP48736 1102 aa22.13■■□□□ 1.13
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HOXB3-202ENST00000460160 RCN2Q14257 317 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 MDS2Q8NDY4 140 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 B3GNT7Q8NFL0 401 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 PHF21BQ96EK2 531 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 SCYL1Q96KG9 808 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 TXLNGYQ9BZA5 131 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 CDCP1Q9H5V8 836 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 ANKRD10Q9NXR5 420 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 H0YIV9 168 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 RNF224P0DH78 156 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 AP5B1Q2VPB7 878 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF766Q5HY98 468 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 L3MBTL4Q8NA19 623 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 TMCO1Q9UM00 188 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 RNF11Q9Y3C5 154 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 OR7A17O14581 309 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 STX16O14662 325 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 MYBL2P10244 700 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 SSR2P43308 183 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 OR1C1Q15619 314 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 ADGRD1Q6QNK2 874 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 SSC4DQ8WTU2 575 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 NR4A3Q92570 626 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 PCTPQ9UKL6 214 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 MYO7BQ6PIF6 2116 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 CTNSO60931 367 aa22.11■■□□□ 1.13
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