RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 STRA6Q9BX79 667 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 ASB8Q9H765 288 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 KCNK13Q9HB14 408 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 NECAP2Q9NVZ3 263 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 DDIT4Q9NX09 232 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 JKAMPQ9P055 326 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 VPS18Q9P253 973 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 HPCAL4Q9UM19 191 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 PCDHA7Q9UN72 937 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF407Q9C0G0 2248 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 A0A1B0GX78 115 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 A0A1W2PS29 197 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 VSTM2BA6NLU5 285 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 GOLGA8SH3BPF8 625 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 TP73O15350 636 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 IGLV3-25P01717 112 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 CHRM2P08172 466 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 MDKP21741 143 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 GATA3P23771 443 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 OPRM1P35372 400 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 PIK3CAP42336 1068 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 CYP2J2P51589 502 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 CLCNKAP51800 687 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 ADARP55265 1226 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 RPS7P62081 194 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 PPIAP62937 165 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 PLGLB1Q02325 96 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 PRKAA1Q13131 559 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 BTBD16Q32M84 506 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 DEFB121Q5J5C9 76 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 HYIQ5T013 277 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 TLDC1Q6P9B6 456 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 PLXDC2Q6UX71 529 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 LRRC31Q6UY01 552 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 RFLNAQ6ZTI6 216 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF550Q7Z398 422 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 CLNKQ7Z7G1 428 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 SRLQ86TD4 932 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 DNAAF5Q86Y56 855 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 ZDHHC22Q8N966 263 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 CCHCR1Q8TD31 782 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 PROX1Q92786 737 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 SCAMP4Q969E2 229 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 MARK4Q96L34 752 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 EXO5Q9H790 373 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 CYP3A43Q9HB55 503 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC23A2Q9UGH3 650 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 POMT2Q9UKY4 750 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 USP22Q9UPT9 525 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 WDR37Q9Y2I8 494 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 PPIAL4AQ9Y536 164 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 MAU2Q9Y6X3 613 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 U3KQK5 164 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 LINC00473A8K010 186 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 IL33O95760 270 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 SETSIPP0DME0 302 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 LYL1P12980 280 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 EZRP15311 586 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 GAP43P17677 238 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 CALRP27797 417 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 SERPINA4P29622 427 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 CCT5P48643 541 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 CYB561P49447 251 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 RENBPP51606 427 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 ITGA8P53708 1063 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 RAD23BP54727 409 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 EMP2P54851 167 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 KIF5AQ12840 1032 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 NME3Q13232 169 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 GTF2H3Q13889 308 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 KRT72Q14CN4 511 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 NRF1Q16656 503 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF626Q68DY1 528 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 PMF1Q6P1K2 205 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 DEF8Q6ZN54 512 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 SH2D5Q6ZV89 423 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF683Q8IZ20 524 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 C4orf32Q8N8J7 132 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 XXYLT1Q8NBI6 393 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 EXD1Q8NHP7 514 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 HTRA1Q92743 480 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 TRIM63Q969Q1 353 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 SUCNR1Q9BXA5 334 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-203ENST00000459697 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74 ms