RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454859.7

ECHDC1-210, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC1, Length 2,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-210ENST00000454859 FAM46DQ8NEK8 389 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.5□□□□□ -1.37
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ECHDC1-210ENST00000454859 OR10A6Q8NH74 314 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 WDR48Q8TAF3 677 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 GAB3Q8WWW8 586 aa6.5□□□□□ -1.37
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ECHDC1-210ENST00000454859 SPHK1Q9NYA1 384 aa6.49□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 CALML5Q9NZT1 146 aa6.49□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.49□□□□□ -1.37
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ECHDC1-210ENST00000454859 EML2O95834 649 aa6.49□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 WNT1P04628 370 aa6.49□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 UQCRBP14927 111 aa6.49□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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ECHDC1-210ENST00000454859 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 MTPNP58546 118 aa6.49□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 PRR5P85299 388 aa6.49□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 TNFRSF17Q02223 184 aa6.49□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.49□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa6.49□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 LYSMD4Q5XG99 296 aa6.49□□□□□ -1.37
ECHDC1-210ENST00000454859 FCRL6Q6DN72 434 aa6.49□□□□□ -1.37
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