RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446439.1

RPS29P28-201, Transcript of ribosomal protein S29 pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene RPS29P28, Length 141 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P28-201ENST00000446439 APOFQ13790 326 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 RCAN2Q14206 197 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 GNA13Q14344 377 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 CSHL1Q14406 222 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 KCNAB1Q14722 419 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 NR1D2Q14995 579 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 TMEM132DQ14C87 1099 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 VEPH1Q14D04 833 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 EMC2Q15006 297 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 ARHGEF6Q15052 776 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 OXA1LQ15070 435 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 TGFBIQ15582 683 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 TRAM1Q15629 374 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 TRIP10Q15642 601 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 RAB30Q15771 203 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 ZBTB6Q15916 424 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 BCL2A1Q16548 175 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 UBE2SQ16763 222 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 ZSWIM7Q19AV6 140 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 LRRC36Q1X8D7 754 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 RGS21Q2M5E4 152 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 TMEM44Q2T9K0 475 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 ZNF699Q32M78 642 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 PTCHD3Q3KNS1 767 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 GRAMD1BQ3KR37 738 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 TBC1D25Q3MII6 688 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 TTLL9Q3SXZ7 439 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 TRIM60Q495X7 471 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 C5orf22Q49AR2 442 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 GPR33Q49SQ1 333 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 RAB41Q5JT25 222 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 FAM209BQ5JX69 171 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 SLC25A30Q5SVS4 291 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 CLVS2Q5SYC1 327 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 FNBP1LQ5T0N5 605 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 ATF7IP2Q5U623 682 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 ANXA8L1Q5VT79 327 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 MEDAGQ5VYS4 303 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 FAM90A2PQ658T7 463 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 KCTD11Q693B1 232 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 OR6B2Q6IFH4 312 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 LCN8Q6JVE9 175 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 PRR5LQ6MZQ0 368 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 CGB2Q6NT52 195 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 ZNF544Q6NX49 715 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 NOTUMQ6P988 496 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 SLC27A1Q6PCB7 646 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 C16orf87Q6PH81 154 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 IZUMO2Q6UXV1 221 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 RANBP10Q6VN20 620 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 ZYG11AQ6WRX3 759 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 DCDC5Q6ZRR9 648 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 RFX8Q6ZV50 586 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 LRRC8DQ7L1W4 858 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 PRSS48Q7RTY5 328 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 LUZP2Q86TE4 346 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 SERPINA11Q86U17 422 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 ITIH5Q86UX2 942 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 GPR180Q86V85 440 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 MON1AQ86VX9 555 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 KCNMB4Q86W47 210 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 CARM1Q86X55 608 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 METTL23Q86XA0 190 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 DNAAF5Q86Y56 855 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 PLCZ1Q86YW0 608 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 RASGRP3Q8IV61 690 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 P3H2Q8IVL5 708 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 HERC6Q8IVU3 1022 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 SYTL1Q8IYJ3 562 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 ADGRF2Q8IZF7 708 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 DEFB107AQ8IZN7 70 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 DSELQ8IZU8 1212 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 THEM5Q8N1Q8 247 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 UBE2J2Q8N2K1 259 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 SLC43A2Q8N370 569 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 TCAIMQ8N3R3 496 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 WDTC1Q8N5D0 677 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 TEX26Q8N6G2 289 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 IQCF1Q8N6M8 205 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 GDPD1Q8N9F7 314 aa1.09□□□□□ -2.23
RPS29P28-201ENST00000446439 DNAAF3Q8N9W5 541 aa1.09□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms