RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 EPHA6Q9UF33 1036 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 AMY2BP19961 511 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 KCNC1P48547 511 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 RHDQ02161 417 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SCGB2A2Q13296 93 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SLC22A10Q63ZE4 541 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 NEIL3Q8TAT5 605 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 NOTOA8MTQ0 251 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 PEX14O75381 377 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SLC9A3P48764 834 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ZNF81P51508 661 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 FXYD6P3P58550 94 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SIRPB2Q5JXA9 342 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SMYD5Q6GMV2 418 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 PXKQ7Z7A4 578 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SLC51AQ86UW1 340 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 C10orf82Q8WW14 230 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 HMGB4Q8WW32 186 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CCDC32Q9BV29 185 aa6.45□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 MYBPHLA2RUH7 354 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 NIPSNAP2O75323 286 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 RFPL1O75677 317 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 JMJD7P0C870 316 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 HSD17B7P56937 341 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 GJA9P57773 515 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 GALK2Q01415 458 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 IL17AQ16552 155 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CYBRD1Q53TN4 286 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CANT1Q8WVQ1 401 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 THAP4Q8WY91 577 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 KIAA1191Q96A73 305 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 OR4K3Q96R72 315 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SPIN2AQ99865 258 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 KLHL21Q9UJP4 597 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 C2orf74A8MZ97 194 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 GPR25O00155 361 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ANKRD28O15084 1053 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 FAM189A1O60320 539 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 MAN2A2P49641 1150 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SLC18A2Q05940 514 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 PIGGQ5H8A4 983 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 LBX2Q6XYB7 198 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ZNF283Q8N7M2 679 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 NAT8LQ8N9F0 302 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 BBS10Q8TAM1 723 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 LRRN4Q8WUT4 740 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 KLRG1Q96E93 195 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 LRIG1Q96JA1 1093 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SULT4A1Q9BR01 284 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 TPT1P8Q9HAU6 139 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CTPS2Q9NRF8 586 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SRRDQ9UH36 339 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CPED1A4D0V7 1026 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 GPR89AB7ZAQ6 455 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 KLF11O14901 512 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 POP7O75817 140 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 GPR89BP0CG08 455 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 RIDAP52758 137 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 PTPRRQ15256 657 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 TSPAN33Q86UF1 283 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 POGLUT1Q8NBL1 392 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 OR5L2Q8NGL0 311 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 TSGA13Q96PP4 275 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 PHOX2BQ99453 314 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 REEP4Q9H6H4 257 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 COL20A1Q9P218 1284 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 POU2F3Q9UKI9 436 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 EFCAB7A8K855 629 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SSX5O60225 188 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CHMP24386 653 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 RFC2P35250 354 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 MAGEA3P43357 314 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 PMS2P3Q13401 168 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CHRNA6Q15825 494 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 RAB41Q5JT25 222 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 KIAA0895LQ68EN5 471 aa6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms