RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432105.5

PUM2-208, Transcript of pumilio RNA binding family member 2, human

TSL 5

Gene PUM2, Length 584 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM2-208	ENST00000432105	NCF4	Q15080	339 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	EFNB3	Q15768	340 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	SYT16	Q17RD7	645 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	AMZ1	Q400G9	498 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	EPC2	Q52LR7	807 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	TEX38	Q6PEX7	206 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67	6e-10	■■■■■ 42.5
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	SPATA21	Q7Z572	469 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	PIM3	Q86V86	326 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	SLC43A2	Q8N370	569 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	SLC5A8	Q8N695	610 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	THAP6	Q8TBB0	222 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	STARD8	Q92502	1023 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	MTBP	Q96DY7	904 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	HES6	Q96HZ4	224 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	CCT7	Q99832	543 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	SSX3	Q99909	188 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	PKP2	Q99959	881 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	PINK1	Q9BXM7	581 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	NYAP2	Q9P242	653 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	CD300A	Q9UGN4	299 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105		Q9Y3F1	56 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105		A0A075B6Q4	140 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	OOEP	A6NGQ2	149 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	PLK4	O00444	970 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	LINC01565	O15544	149 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	CLDN3	O15551	220 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	MBTPS2	O43462	519 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	KRT86	O43790	486 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	NDUFS7	O75251	213 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF217	O75362	1048 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	RHBDL1	O75783	438 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	SERPINI2	O75830	405 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	KRT6B	P04259	564 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	LIPF	P07098	398 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	IVL	P07476	585 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	FGF2	P09038	288 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	CYP2A7	P20853	494 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	UGT1A1	P22309	533 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	HRH2	P25021	359 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	CHML	P26374	656 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	SLC1A4	P43007	532 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	PTGER3	P43115	390 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	MAGEA1	P43355	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	KRT6C	P48668	564 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	CTSC	P53634	463 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	ACTR3	P61158	418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	SPIB	Q01892	262 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF273	Q14593	569 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	MELK	Q14680	651 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	MTX3	Q5HYI7	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	HHAT	Q5VTY9	493 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	C18orf63	Q68DL7	685 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	LCN10	Q6JVE6	187 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	BATF2	Q8N1L9	274 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PUM2-208	ENST00000432105	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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