RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 MYO9BQ13459 2157 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 WRBO00258 174 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 TIMP1P01033 207 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 TUBA3CQ13748 450 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 CATSPEREQ5SY80 951 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 METTL7AQ9H8H3 244 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 IL26Q9NPH9 171 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 MYH3P11055 1940 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 ADRB3P13945 408 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 PTNP21246 168 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 C5AR1P21730 350 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 NTSR1P30989 418 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 HTR6P50406 440 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 TCEAL6Q6IPX3 200 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 KDM1BQ8NB78 822 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 ZDHHC12Q96GR4 267 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 SPATA9Q9BWV2 254 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A0X1KG70 313 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 ZBTB42B2RXF5 422 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 AURKAO14965 403 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 EMC8O43402 210 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 TM9SF2Q99805 663 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 GPR174Q9BXC1 333 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC22A4Q9H015 551 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 LINC00597Q9H2U6 94 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 OR51I1Q9H343 314 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 PRODH2Q9UF12 536 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 RTCAO00442 366 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 CDRT1O95170 752 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC6A9P48067 706 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 DSG2Q14126 1118 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 NFE2L1Q14494 772 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 COQ5Q5HYK3 327 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 SCML4Q8N228 414 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 B3GNT4Q9C0J1 378 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 LIPT1Q9Y234 373 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 FEZF1A0PJY2 475 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 RASAL1O95294 804 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 ELK4P28324 431 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 PIP5K1AQ99755 562 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC12A9Q9BXP2 914 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 MID1O15344 667 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 FHP07954 510 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 HSD11B1P28845 292 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 TPTEP56180 551 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC39A11Q8N1S5 342 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 LNX2Q8N448 690 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM174Q8WUU8 243 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 THEM6Q8WUY1 208 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 PTCHD1Q96NR3 888 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 MTMR10Q9NXD2 777 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 MAGEA6P43360 314 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 RAB15P59190 212 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 ADAM17P78536 824 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF627Q7L945 461 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 CLCC1Q96S66 551 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 WASH4PA8MWX3 477 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 PLGP00747 810 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 PFKLP17858 780 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 HK1P19367 917 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 CD72P21854 359 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 ITGA3P26006 1051 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 GABRA3P34903 492 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 DCDC1P59894 354 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 SCRN3Q0VDG4 424 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 C6orf120Q7Z4R8 191 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 GPR150Q8NGU9 434 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 GPRC5BQ9NZH0 403 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 ETV4P43268 484 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 MANEALQ5VSG8 457 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 MEDAGQ5VYS4 303 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 UNC5DQ6UXZ4 953 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 ASB18Q6ZVZ8 466 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF550Q7Z398 422 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 GRHPRQ9UBQ7 328 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM221BA6H8Z2 402 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 DRGXA6NNA5 263 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 DHRS4L1P0CG22 281 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 KIAA0319Q5VV43 1072 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 PTERQ96BW5 349 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 HSPBAP1Q96EW2 488 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 CASD1Q96PB1 797 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 CST11Q9H112 138 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 FZD3Q9NPG1 666 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 TBC1D24Q9ULP9 559 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms