RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF226Q9NYT6 803 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 SPATA7Q9P0W8 599 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 TRBC2A0A5B9 178 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 PRAMEF10O60809 474 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 RPN2P04844 631 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 GABRB1P18505 474 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 DDCP20711 480 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 CD97P48960 835 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 C17orf64Q86WR6 236 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 CXorf40AQ8TE69 158 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 IL17FQ96PD4 163 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 GIN1Q9NXP7 522 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 DEC1Q9P2X7 70 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 DAPK2Q9UIK4 370 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 RAB23Q9ULC3 237 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 SH3GLB1Q9Y371 365 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 ANKDD1BA6NHY2 528 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 GADD45GO95257 159 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 NFATC1O95644 943 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 IFNW1P05000 195 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 ERGP11308 486 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC19A1P41440 591 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 GSSP48637 474 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 IDH2P48735 452 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 OXA1LQ15070 435 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 INAQ16352 499 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 DEPDC1Q5TB30 811 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF697Q5TEC3 545 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 PAGE2Q7Z2X7 111 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC103Q8IW40 242 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 PDXPQ96GD0 296 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 COL21A1Q96P44 957 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 QRFPRQ96P65 431 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 AIF1LQ9BQI0 150 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 BTBD2Q9BX70 525 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 IMPAD1Q9NX62 359 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC6A11P48066 632 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 CLK1P49759 484 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 TIGD6Q17RP2 521 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM236Q5W0B7 351 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 AMZ2Q86W34 360 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 OR5AR1Q8NGP9 310 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 PROX1Q92786 737 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 NEURL3Q96EH8 262 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 CRELD1Q96HD1 420 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 COX14Q96I36 57 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 PCBD2Q9H0N5 130 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 CXorf36Q9H7Y0 433 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 A4GALTQ9NPC4 353 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 DPP7Q9UHL4 492 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 PLK4O00444 970 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 AIREO43918 545 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 MPZL2O60487 215 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 BMP4P12644 408 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 CBLP22681 906 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 LIPAP38571 399 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 CTSKP43235 329 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 SAXO2Q658L1 398 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 RSPRY1Q96DX4 576 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 DUSP12Q9UNI6 340 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 M0R082 166 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 CDH3P22223 829 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 MAPK12P53778 367 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 CDC42P60953 191 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 RELAQ04206 551 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 BTLAQ7Z6A9 289 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 DSG4Q86SJ6 1040 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 OR9Q2Q8NGE9 314 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 RAB7BQ96AH8 199 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 DCSTAMPQ9H295 470 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 WASH6PQ9NQA3 447 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 PLAGL1Q9UM63 463 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 C5orf58C9J3I9 102 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 J3KTA2 159 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 PLPP1O14494 284 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 PCDH17O14917 1159 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 PORP16435 677 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 GSTM5P46439 218 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 MESP2Q0VG99 397 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 EGFL6Q8IUX8 553 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 STX19Q8N4C7 294 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 MS4A8Q9BY19 250 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 NT5DC2Q9H857 520 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 KCND3Q9UK17 655 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms